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翘嘴鳜3个不同群体的遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 曾庆凯 1 ; 孙成飞 2 ; 董浚键 2 ; 田园园 2 ; 师红亚 2 ; 焦真真 2 ; 叶星 3 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;上海海洋大学水产与生命学院

2.;中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;上海海洋大学水产与生命学院

3.;中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;上海海洋大学水产与生命学院;

关键词: 翘嘴鳜;微卫星;LED诱导荧光检测系统;遗传多样性;遗传结构

期刊名称: 基因组学与应用生物学

ISSN: 1674-568X

年卷期: 2017 年 08 期

页码: 3241-3250

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究采用微卫星分子标记技术分析翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)3个群体,包括广东(GD)与安徽(AH)的养殖群体、湖南(HN)的野生群体的遗传多样性及遗传结构。采用PCR和聚丙烯酰胺凝胶电泳法从源自Gen Bank的30对微卫星引物筛选出10对具有特异性和多态性的引物,用于上述3个群体共162个个体的PCR扩增。使用LED诱导荧光检测系统对扩增产物进行毛细管电泳,Q-ANALYZER软件对电泳结果进行分型,结果显示各微卫星位点均有较高的多态信息含量(PIC=0.445~0.895),各群体的遗传多样性水平较高(期望杂合度He=0.689~0.730)。群体间存在较高的基因流(平均基因流N_m=6.040)。群体遗传分化指数(F_(ST))分析显示,总体遗传分化水平较低(F_(ST)=0.046 7),群体间遗传分化为中低水平(F_(ST)=0.034 5~0.060 4)。AMOVA分析显示群体间遗传变异仅占4.67%,群体内遗传变异占95.33%。群体间UPGMA系统进化分析显示,GD群体与HN群体聚为一支,AH群体单独聚为一支。个体间UPGMA系统进化树显示3个群体个体排列呈镶嵌式,未出现明显的地理群体分支,且STRUCTURE群体结构分析显示各群体均可被分为亚群Ⅰ和亚群Ⅱ(K=2),说明群体间的遗传关系较近。综上所述,所分析的广东、安徽与湖南3个翘嘴鳜群体间的遗传变异程度较低,群体内遗传变异程度较高,各群体均具较高的遗传多样性,因此这3个群体均适合作为品种选育的基础群体。本研究结果为下一步翘嘴鳜优良品种选育方案的确立提供了依据。

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