文献类型： 中文期刊

作者： 张立春 ¹ ; 李兆华 ¹ ; 李梦姝 ¹ ; 孙福亮 ² ; 曹阳 ¹ ; 朴庆林 ¹ ; 金海国 ¹ ; 张树敏 ¹ ;

作者机构： 1.吉林省农业科学院畜牧分院

2.延边大学农学院

关键词： 黏病毒耐药蛋白1基因;民猪;大白猪;野杂猪;基因多态性

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2017 年 44 卷 04 期

页码： 1046-1053

收录情况： 北大核心

摘要： 为探讨不同遗传背景猪黏病毒耐药蛋白1(myxovirus resistance,Mx1)基因的遗传多态性,本试验采用RT-PCR方法扩增克隆出猪Mx1基因并进行生物信息学分析,采用高分辨率熔解曲线法(HRM)对民猪、长白山野猪与民猪杂交猪(简称野杂猪)和大白猪3个群体Mx1基因外显子2区多态性进行分析。结果显示,从民猪及野杂猪中成功克隆出4条Mx1基因mRNA序列。该序列含有1个1 992bp的完整开放阅读框(ORF),编码663个氨基酸。比较发现4条Mx1基因序列中共含有30个SNPs位点,其中17个SNPs位点引起了氨基酸序列的变异。功能结构域分析发现,大部分氨基酸突变位点位于Mx1基因功能结构域两侧。HRM多态性分析显示,Mx1基因外显子2区DD基因型作为优势基因型在3个群体中具有最高的基因型频率,其中大白猪中DD基因型频率为100%,野杂猪为62.5%,民猪为56.2%。基因多态性分析还发现该区域存在更多的核苷酸及氨基酸突变位点,表明民猪和野杂猪Mx1基因存在更丰富的基因多态性。