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基于形态和分子标记的三种鲭科鱼类鉴别新方法

文献类型: 中文期刊

作者: 黄昊 1 ; 程起群 2 ; 郑将臣 2 ;

作者机构: 1.南京农业大学无锡渔业学院

2.农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室

关键词: 鲭科;形态分析;分子标记;物种鉴别;资源管理

期刊名称: 海洋渔业

ISSN: 1004-2490

年卷期: 2011 年 33 卷 03 期

页码: 297-303

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为找到日本鲭(Scomber japonicus)、澳洲鲭(S.australasicus)和羽鳃鲐(Rastrelliger kanagurta)这三种鲭科鱼类鉴别的新标记,采用形态框架等形态分析方法和线粒体标记的方法开展研究。共分析采自海南的33 ind样本,其中日本鲭19 ind,澳洲鲭9 ind,羽鳃鲐5 ind。形态判别分析显示,利用2个可量参数(体高和眼径)或者3个框架参数[D(2-3)、D(3-5)、D(2-4)]构建的判别公式均能鉴别这三种鲭科鱼类,判别准确率均为100%。通过PCR扩增和测序,获得三种鲭科鱼类的线粒体细胞色素b(Cytb)和控制区(D-loop)序列。经对位排列,得到33 ind样本Cytb和D-loop的一致序列分别为1 118 bp和846 bp。Cytb基因共检出17个单倍型,变异位点195个,其中10个固定位点是日本鲭所特有,8个固定位点是澳洲鲭所特有,147个固定位点为羽鳃鲐所特有;D-loop序列共得到27个单倍型,变异位点239个,其中13个固定位点为日本鲭所特有,10个固定位点为澳洲鲭所特有,182个固定位点为羽鳃鲐所特有。这些固定位点可以作为三种鲭科鱼类鉴别的分子标记。

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