文献类型： 中文期刊

作者： 李莹 ¹ ; 何国戈 ¹ ; 王艳 ¹ ; 何静怡 ¹ ; 黄爱珍 ¹ ; 郑经成 ¹ ; 葛影影 ¹ ; 罗成龙 ¹ ;

作者机构： 1.广东省农业科学院动物科学研究所畜禽育种国家重点实验室广东省畜禽育种与营养研究重点实验室广东省动物育种与营养公共实验室;清远市农业科技推广服务中心清远市农业科学研究所

关键词： 优质鸡;线粒体DNA(mtDNA);D-loop区;遗传多样性

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2020 年 02 期

页码： 469-478

收录情况： 北大核心

摘要： 本研究旨在利用线粒体DNA(mtDNA) D-loop区序列分析清远麻鸡群体1、清远麻鸡群体2、阳山鸡和清远黄羽乌鸡4个优质鸡群体mtDNA D-loop区遗传多样性。根据GenBank中红原鸡mtDNA序列(登录号:NC_007235.1)针对D-loop区设计特异性引物,PCR扩增并测序后对序列进行分析,统计单倍型数、多态位点数、单倍型多样度、核苷酸多样度和核苷酸平均差异数等,利用Mega 5.10软件计算品种间进化分歧,并构建系统进化树。结果显示,获得了4个优质鸡群体D-loop区长约591 bp序列,经比对后对其中的549 bp进行分析,A、T、C和G碱基含量分别为27.2%～27.3%、30.1%～30.4%、29.5%～29.8%和12.8%～12.9%,G+C平均含量为42.5%,共发现92处单核苷酸多态位点,其中单一多态位点14个、简约信息位点78个,转换和颠换分别占89.13%(82/92)和10.87%(10/92);单倍型多样度为0.682～0.835,核苷酸多样度为0.00849～0.01167;共存在32种单倍型,可分为A、B、C和E共4个分支,其中B(51.2%)和E(37.6%)为优势分支。基于单倍型构建系统进化树发现,4个优质鸡群体可以归为4大分支,与单倍型分类结果一致。表明4个优质鸡群体均具有中等以上多样性,揭示4个优质鸡群体在进化过程中存在两个及两个以上的母系来源。