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芋淀粉合成酶AGPase基因的克隆及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王立 1 ; 殷剑美 1 ; 韩晓勇 1 ; 张培通 1 ; 郭文琦 1 ; 李春宏 1 ;

作者机构: 1.江苏省农业科学院经济作物研究所

关键词: 芋;淀粉合成酶;基因克隆;表达分析

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2016 年 43 卷 06 期

页码: 1117-1125

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 通过对‘靖江香沙芋’转录组数据进行功能注释,克隆获得‘靖江香沙芋’淀粉合成酶AGPase的基因,序列全长为1 596 bp,命名为CeApS1(NCBI:Colocasia KU288757,未公布)。该基因编码532个氨基酸,蛋白含有1个NTP_transf_3结构域(Gly~(104)~Pro~(306))和1个Pb H1结构域(Gly~(473)~Ser~(515)),编码产生AGPase小亚基,等电点和分子量分别为6.73和57.6 k D。ApS1在单子叶和双子叶植物中广泛存在,CeApS1与紫萍(AIZ00992.1)中相应蛋白的亲缘关系最近,相似性为83.4%,与草莓(AAS00541.1)、苜蓿(XP_003617925.1)、水稻(AAK27313.1)和小麦(CAA46879.1)等植物中相应蛋白的亲缘关系较远。CeApS1在‘靖江香沙芋’的母芋和子孙芋中表达量较高,在叶片、叶柄和根中低表达。芋球茎中的CeApS1表达水平与球茎发育密切相关,在播种160 d后达到最大值。该基因的表达模式与球茎淀粉含量的积累显著正相关。

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