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紫苏密码子偏好性分析及fad3基因的异源表达预测

文献类型： 中文期刊

作者： 张天缘 1 ; 沈奇 1 ; 宋莉 1 ;

作者机构： 1.贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院;贵州省油菜研究所

关键词： 紫苏;密码子偏好性;异源表达

期刊名称： 山地农业生物学报

ISSN： 1008-0457

年卷期： 2017 年 05 期

页码： 14-21

摘要： 紫苏α-亚麻酸(ALA)含量极高,其合成相关基因偏好性及异源表达宿主的阐明,是揭示紫苏不饱和脂肪酸调控机制及表达生产的重要前提。本研究从密码子特性、有效密码子数、相对使用度、最优密码子、碱基相关性、奇偶偏好性及异源表达特性等方面,对不同形成时期的紫苏种子转录组序列进行密码子偏好性分析,并对筛选出的pf FAD3s基因进行三种微生物异源表达预测分析比较。结果表明:紫苏转录核酸序列中的GC含量为45.85%,大部分基因密码子偏好性相对较弱,其蛋白编码基因密码子偏好以A/T结尾;pf FAD3s基因异源表达的适宜微生物宿主为酿酒酵母。分析结果为进一步研究紫苏ALA合成的分子调控奠定了基础,并为其微生物基因工程生产提供了一定依据。

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