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6个植物核糖体失活蛋白新基因片段的克隆及特征分析

文献类型: 中文期刊

作者: 阮小蕾 1 ; 刘丽芳 1 ; 陈秀 1 ; 何自福 2 ; 李华平 1 ;

作者机构: 1.华南农业大学植物病毒研究室

2.广东省农业科学院植物保护研究所

关键词: 核糖体失活蛋白;基因克隆;序列分析

期刊名称: 华中农业大学学报

ISSN: 1000-2421

年卷期: 2008 年 27 卷 01 期

页码: 13-17

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 通过分析多种不同来源的植物RIPs的氨基酸序列,据其保守区域设计1对植物通用简并引物P1、P2,对基因组进行PCR扩增,分别从海芋Araceae macrorrhiza、烟草Nicotiana tobaccum、剑麻Agavaccae aga-ve、望江南Cassia occidentalis、那坡指天蕉Musaspp.(BB)、邻水野蕉Musaspp.(AA)中获得1个基因片段。BLAST分析表明:它们推导的氨基酸序列只与多种不同来源的RIPs有相似性。其中,与葫芦科2个代表RIP相应区段的相似性最高,与-βluffin基因的相似性分别为97.2%、98.5%、97.9%、89.4%、97.9%、97.2%,与天花粉蛋白(trichosanthin,TCS)的相似性分别为63.6%、64.5%、64.1%、60.8%、64.8%、和63.6%。多重序列比对发现:6个序列中分别有10、9、11、11、9、10个残基氨基酸与TCS的N-糖苷酶活性位点的残基完全相同,只是残基位置不一致,仅有个别残基发生了变化。所有的N-糖苷酶活性位点都在P1/P2扩增区段内。

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