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胡椒实时荧光定量PCR内参基因的筛选

文献类型： 中文期刊

作者： 胡丽松 1 ; 范睿 1 ; 伍宝朵 1 ; 吴刚 1 ; 谭乐和 1 ; 郝朝运 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院香料饮料研究所

关键词： 胡椒;实时荧光定量PCR;内参基因

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2017 年 10 期

页码： 1901-1906

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为筛选胡椒不同组织间稳定表达的最佳内参基因,以胡椒栽培种‘热引1号’的主根、主蔓、花序和不同发育时期果实共8个组织为材料,采用实时荧光定量PCR技术,分析Polyubiquitin 1、Polyubiquitin 2、Polyubiquitin 3、GAPDH 1、GAPDH 2、Histone 3-1、Histone 3-2、Cyclophilin、Actin等共9个不同持家基因的表达差异情况。基于各个基因的Ct值,利用ge Norm、Norm Finder和Best Keeper分析候选持家基因表达的稳定性。结果表明,在不同的组织中,9个持家基因的表达量存在差异。3个软件分析出的结果有所不同,综合分析结果显示,Histone 3-1表达最为稳定,其次为Polyubiquitin 1、GAPDH-2。内参基因标准化因子的配对差异分析(Vn/n+1)表明,Histone 3-1和Polyubiquitin 1是分析胡椒基因表达模式的最佳内参基因组合。

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[11]利用geNorm、NormFinder和BestKeeper软件进行内参基因稳定性分析的方法. 吴建阳,何冰,杜玉洁,李伟才,魏永赞. 2017

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