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鸭病毒性肝炎病毒NA株全基因序列测定及分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王劭 1 ; 陈少莺 1 ; 朱小丽 1 ; 程晓霞 1 ; 陈仕龙 1 ; 林锋强 1 ; 李兆龙 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所

关键词: 鸭肝炎病毒;DHV-NA株;全基因组;序列分析

期刊名称: 福建农业学报

ISSN: 1008-0384

年卷期: 2010 年 25 卷 01 期

页码: 18-22

摘要: 应用RT-PCR方法分段扩增DHV-NA株cDNA,并进行基因组全序列测定及同源性等分析。结果显示DHV-NA株基因组全长7 692 bp(不包括PolyA),5'和3'非编码区长度分别为626 bp和316 bp,有1个单一开放阅读框架(ORF,627~7 376 nt),编码2 249个氨基酸;与I型DHV(DHV-Ⅰ)参考株比较,其核苷酸和氨基酸同源性分别为94.3%~96.9%和97.8%~98.8%;与新型DHV(N-DHV)90D株比较,其核苷酸和氨基酸同源性分别为72.6%和82.3%。表明NA株与DHV-Ⅰ参考株遗传进化关系较密切,而与N-DHV遗传关系较远。

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