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21种植物八氢番茄红素合成酶的生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李宁 1 ; 王柏柯 1 ; 杨生保 1 ; 唐亚萍 1 ; 王强 1 ; 杨涛 1 ; 帕提古丽 1 ; 余庆辉 1 ;

作者机构: 1.新疆农业科学院园艺作物研究所

关键词: 八氢番茄红素合成酶;系统进化;生物信息学分析

期刊名称: 新疆农业科学

ISSN: 1001-4330

年卷期: 2015 年 52 卷 12 期

页码: 2157-2165

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】对番茄等21种植物的八氢番茄红素合成酶(phytoene synthase,PSY)进行生物信息学分析,为研究植物八氢番茄红素合成酶的结构与功能分析奠定基础。【方法】采用Blast、Prot Param和Signal P等生物信息学软件,对番茄、拟南芥、辣椒和胡萝卜等21种植物PSY的理化性质、蛋白结构和系统发生树等进行分析。【结果】21种植物PSY氨基酸不存在信号肽,不具有跨膜结构,推测PSY可能定位于细胞质叶绿体中发挥功能,二级结构由α螺旋、无规则卷曲和延伸链等结构元件组成。【结论】PSY蛋白为较不稳定亲水性蛋白,亚细胞定位于叶绿体上。不经过跨膜转运,而是直接在细胞质基质中形成。

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