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罗非鱼微卫星DNA指纹的计算机化鉴定

文献类型： 中文期刊

作者： 宋红梅 1 ; 白俊杰 2 ; 刘宇飞 2 ; 李胜杰 2 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院珠江水产研究所

2.中国水产科学研究院珠江水产研究所,中国水产科学研究院热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室

关键词： 罗非鱼;种质鉴定;计算机化DNA指纹;微卫星

期刊名称： 渔业现代化

ISSN： 1007-9580

年卷期： 2008 年 35 卷 05 期

页码： 21-24

收录情况： 北大核心

摘要： 在奥利亚、尼罗和橙色莫桑比克3种罗非鱼的微卫星DNA指纹数据库构建基础上,为进一步开展实际生产应用而将其鉴定功能计算机化。在数据库中每种鱼都有其特异的DNA指纹,根据等位基因的有或无,把每个个体的指纹转换成由数字1和0组成的指纹数据,变为计算机可识别的语言,在此基础上,利用Net语言开发了一套应用软件——鱼类种质鉴定软件1.0,根据微卫星标记的共显性遗传原理,采用Nei公式,计算查询个体与相关群体的遗传距离,追溯该个体的可能来源。在实际应用中,只需将测试样品的扩增结果转换成指纹数据,由计算机辅助进行种质鉴定。该软件具有普适性,任何物种的微卫星数据都可导入进行相关的鉴定。

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