您好,欢迎访问新疆农业科学院 机构知识库!

基于简化基因组测序技术的番茄雄性不育基因定位

文献类型: 中文期刊

作者: 王柏柯 1 ; 李宁 2 ; 唐亚萍 2 ; 王强 2 ; 杨涛 2 ; 杨生保 2 ; 帕提古丽 2 ; 余庆辉 2 ; 高杰 3 ;

作者机构: 1.新疆农业大学林学与园艺学院;新疆农业科学院园艺作物研究所

2.;新疆农业大学林学与园艺学院;新疆农业科学院园艺作物研究所

3.;新疆农业大学林学与园艺学院;新疆农业科学院园艺作物研究所;

关键词: 番茄;雄性不育;简化基因组测序;基因定位

期刊名称: 西北农林科技大学学报(自然科学版)

ISSN: 1671-9387

年卷期: 2017 年 06 期

页码: 177-184

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】获得番茄雄性不育基因的候选基因,提高番茄雄性不育基因定位的准确性,为该雄性不育基因的克隆及功能机制研究提供理论基础。【方法】以一个与苗期绿茎基因紧密连锁的花粉败育型材料为母本,以一个苗期紫茎可育系为父本,通过集群分离(BSA)法分别建立30个F2单株的不育和可育DNA池,基于简化基因组测序(SLAF-Seq)技术检测足够量的简化基因组扩增片段,通过关联分析,获得目标雄性不育基因的候选区域,并利用GO数据库对关联区域内的基因进行功能注释。【结果】通过SLAF测序共获得20.27 Mb的序列量;共获得103 250个SLAF标签,标签整体平均深度达160.39倍;完成了2个混合池间SLAF标签标记的多态性分析,共获得多态性标记6 892个;利用2个混合池进行关联分析,共得到8个与目标雄性不育基因相关的候选区域,区域平均大小为0.29Mb,区域内共有27个差异标记,146个候选基因。【结论】利用SLAF测序技术对番茄雄性不育基因进行了初步定位。

  • 相关文献

[1]苗期有绿茎标记性状番茄雄性不育系的初步研究. 王柏柯,杨涛,杨生保,张贵仁,帕提古丽,余庆辉. 2012

[2]番茄雄性不育基因的SRAP分子标记定位. 王柏柯,李宁,唐亚萍,王强,杨涛,杨生保,帕提古丽,余庆辉,高杰. 2017

[3]番茄雄性不育基因的克隆及序列分析. 王柏柯,李宁,唐亚萍,王强,杨涛,杨生保,帕提古丽,余庆辉. 2015

[4]辣椒核雄性不育系pby-1形态学及生理生化特性分析. 裴红霞,李生梅,武旭霞,耿世伟,赖黎丽,高晶霞,董心久. 2023

[5]高粱耐盐分子生物学研究进展. 韩玉翠,叶凯,侯升林,涂振东,吕芃. 2014

[6]加工番茄植株残体腐解液对加工番茄种子萌发的影响. 李志宏,秦勇,高杰. 2012

[7]番茄细菌性病害防治试验研究. 崔元玗,杨华,孙晓军,张升. 2006

[8]利用棉花秸杆作为蔬菜无土栽培基质原料的探索. 崔元玗,张升,孙晓军,杨华,何伟. 2012

[9]番茄生长表型对棉秸秆复合育苗基质理化性质的响应. 王小武,王志方,秦新政,陈竞,代金平,张慧涛,谢玉清. 2019

[10]不同种衣剂对番茄苗期两种病害的防效及其产量的影响. 李进,李杰,段俊杰,唐燕玲,雷斌. 2017

[11]1-甲基环丙烯保鲜纸研制及应用. 吴斌,程琳琳,吴忠红,郭芹,张玉丽,陈维信,李雪萍. 2012

[12]基于农艺措施的日光温室番茄生长发育动态研究. 代兴荣,张黎,潘文远,高卫时. 2015

[13]不同光周期与光质配比对番茄植株生长发育的影响. 何蔚,陈丹艳,胡晓婷,王晓旭,陈乐涵,张海春,杨振超. 2018

[14]化肥减施条件下配施生物有机肥对番茄生长及品质的影响. 唐宇,包慧芳,詹发强,侯敏,王宁,杨蓉,林子敬,龙宣杞. 2019

[15]新疆地区不同番茄品种的光合特异性比较及高光效品种筛选. 李玉姗,宋羽,马艳,吴晓. 2019

[16]PBAT型全生物降解膜对南疆番茄产量及土壤理化性质的影响. 王斌,万艳芳,王金鑫,孙九胜,槐国龙,崔磊,张彦红,魏彦宏,刘国宏. 2019

[17]化肥减施对设施番茄生长生理、产量和品质的影响. 韩宏伟,刘会芳,王强,庄红梅,李磐,蒲胜海,冯广平,王浩. 2018

[18]不同有机肥用量对设施番茄生长发育的影响. 姜婷婷. 2018

[19]不同蔬菜与番茄轮作对设施土壤微生物多样性、酶活性及土壤理化性质的影响. 刘会芳,韩宏伟,王强,庄红梅,王浩. 2021

[20]不同叶背补光模式对戈壁温室番茄品质的影响. 宋羽,蒋程瑶,李玉姗. 2021

作者其他论文 更多>>