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玉米△1-吡咯啉-5-羧酸合成酶基因家族生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 董晨 1 ; 胡会刚 1 ; 决登伟 1 ; 赵秋芳 1 ; 陈宏良 1 ; 贾利强 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院南亚热带作物研究所

关键词： 玉米;△1-吡咯啉-5-羧酸合成酶(P5CS);生物信息;基因家族

期刊名称： 玉米科学

ISSN： 1005-0906

年卷期： 2016 年 24 卷 002 期

页码： 40-46

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： △1-吡咯啉-5-羧酸合成酶(Delta-1-pyrroline-5-carboxylate synthase,P5CS)是脯氨酸代谢途径的关键酶,对植物抵抗逆境胁迫起至关重要的作用.为了探索P5CS在玉米对逆境胁迫的响应,本文对5个玉米P5CS基因家族蛋白的基本理化性质、二级结构预测、亚细胞定位、基因结构、进化关系及保守基序等方面进行初步生物信息分析.结果显示,5个玉米P5CS蛋白中有3个偏酸性,1个显中性,1个偏碱性;2个以无规则卷曲为主要构成元件,3个P5CS蛋白主要以α白螺旋为主要构成元件;不稳定指数分析发现,4个P5CS蛋白为稳定蛋白;疏水性分析表明,所有的P5CS蛋白为亲水性蛋白;玉米P5CS家族内含子最少含有4个内含子,最多的含有19个内含子;亚细胞定位分析表明,P5CS均蛋白定位于细胞基质;进化分析表明,PSCS家族分3个亚家族.

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