文献类型: 中文期刊
作者: 任巧玲 1 ; 白献晓 1 ; 王璟 1 ; 郭红霞 1 ; 陈俊峰 1 ; 马文涛 1 ; 和小娥 1 ; 张家庆 1 ; 邢宝松 1 ;
作者机构: 1.河南省农业科学院畜牧兽医研究所;河南省动物卫生监督所;郑州市动物卫生监督所
关键词: miRNAs;乏情;发情;初产母猪;卵巢
期刊名称: 中国畜牧兽医
ISSN: 1671-7236
年卷期: 2018 年 05 期
页码: 1153-1162
收录情况: 北大核心
摘要: 为了探索卵巢microRNA(miRNA)在初产母猪生殖调控中的作用,本研究利用Illumina高通量测序技术检测了乏情和发情初产母猪卵巢miRNA的表达谱,并对表达量较高且差异显著的miRNA进行生物信息学分析。结果显示,本研究构建的两个small RNA文库共鉴定出503个miRNAs,其中已知的303个,新预测的200个。在已知的miRNA中,ssc-miR-10b在两个文库中的表达量最高,其次为ssc-miR-143-3p和ssc-miR-26a;在新预测的miRNA中,chr13_2637_mature在两个文库中的表达量最高,其次为chr8_9994_mature。与发情母猪相比,共有145个miRNAs发生显著变化(read counts>10,∣log2(fold-change)∣>1),上调114个,下调31个。在进一步筛选的31个表达量较高且差异显著的miRNAs(read counts>1 000,∣log2(fold-change)∣>1)中,新预测的chr13_2585_mature上调倍数最高,且只在乏情母猪卵巢中表达。31个miRNAs共预测到7 388个靶基因,KEGG信号通路分析显示,有2 788个靶基因注释到了297个KEGG通路,前20个最富集的通路部分与生殖过程或生殖活动调控相关,表明这31个miRNAs参与了初产母猪的生殖调控。本研究结果丰富了猪miRNA数据资源,为进一步深入研究初产母猪的繁殖性能提供了理论依据。
- 相关文献
[1]乏情和发情初产母猪下丘脑-垂体-卵巢轴中lincRNAs表达谱比较分析. 任巧玲,张家庆,陆东锋,王璟,陈俊峰,马强,白献晓,郭红霞,高彬文,邢宝松. 2020
[2]乏情和发情初产母猪下丘脑-垂体轴中miRNA表达谱比较分析. 任巧玲,张家庆,王璟,陈俊峰,马强,高彬文,刘付玖,邢宝松. 2023
[3]发情和乏情初产母猪下丘脑-垂体-卵巢轴差异表达基因筛选及分析. 任巧玲,张家庆,郭红霞,王献伟,王璟,吕玲燕,陈俊峰,马强,张彬,邢宝松,徐泽君. 2021
[4]LAT基因簇miRNA的CRISPR/Cas9基因编辑对马立克病病毒体外复制的影响分析. 楚钰淑,滕蔓,周子誉,石彬,郑鹿平,刘金玲,罗俊,张改平. 2021
[5]Identification and Functional Analysis of microRNAs Involved in the Anther Development in Cotton Genic Male Sterile Line Yu98-8A. Xiaojie Yang,Yuanming Zhao,Deyi Xie,Yao Sun,Xunlu Zhu,Nardana Esmaeili,Zuoren Yang,Ye Wang,Guo Yin,Shuping Lv,Lihong Nie,Zhongjie Tang,Fu’an Zhao,Wu Li,Neelam Mishra,Li Sun,Wei Zhu,Weiping Fang. 2016
[6]The miRNAs and their regulatory networks responsible for pollen abortion in Ogura-CMS Chinese cabbage revealed by high-throughput sequencing of miRNAs, degradomes, and transcriptomes. Wei, Xiaochun,Yao, Qiuju,Yuan, Yuxiang,Zhao, Yanyan,Zhang, Qiang,Wang, Zhiyong,Jiang, Wusheng,Zhang, Xiaowei,Zhang, Xiaohui,Li, Xixiang,Wei, Fang. 2015
作者其他论文 更多>>
-
多花黄精PcWRKY1基因的克隆及响应高温胁迫功能分析
作者:贾慧;赵玉龙;郭晓阳;杨铁钢;郭红霞;苏秀红;腊贵晓
关键词:多花黄精;WRKY转录因子;高温胁迫;生物信息学分析;功能分析
-
总结盘点,指引未来-《猪业科学》2025年第2期读后感
作者:张家庆
关键词:
-
基于重测序数据的猪繁殖性状全基因组关联分析
作者:吕玲燕;林昌华;张胜斌;覃秀珍;柏秀芳;吴永绍;陈钊;刘磊;孙如玉;张冰;张家庆
关键词:重测序;猪;繁殖性状;全基因组关联分析
-
阿戈美拉汀对猪卵母细胞体外成熟及手工克隆胚胎发育潜能的影响
作者:张家庆;沈开元;孙如玉;胡湘云;刘明君;刘征;李仕彦;张冰;吕玲燕
关键词:阿戈美拉汀;猪;卵母细胞;手工克隆胚胎;发育潜能
-
CRISPR/Cas9基因编辑技术在畜禽育种中的研究进展
作者:贾名扬;王磊;陈俊峰;张家庆;闫祥洲;邢宝松;王璟
关键词:CRISPR/Cas9系统;基因编辑;畜禽育种
-
多组学技术在畜禽重要经济性状研究中的应用
作者:王亚鑫;王璟;田学凯;杨公社;于太永
关键词:畜禽;多组学技术;经济性状
-
油莎豆茎豆形成相关代谢物挖掘及通路富集分析
作者:郭晓阳;腊贵晓;许欣然;余彦鸽;代丹丹;李彦鹏;王艳红;郭红霞;杨铁钢
关键词:油莎豆;匍匐茎;茎豆形成;代谢组学;氨基酸类;黄酮类