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荔枝EST-SSR分子标记开发与种质资源遗传多样性分析

文献类型: 会议论文

第一作者: 向旭

作者: 向旭 1 ; 白丽军 2 ; 赵俊生 3 ; 欧良喜 1 ; 孙清明 1 ; 陈洁珍 1 ; 蔡长河 1 ;

作者机构: 1.广东省农业科学院果树研究所,广州,510640

2.广东省农业科学院果树研究所,广州,510640 四川农业大学园艺学院,雅安,625014

3.广东省农业科学院果树研究所,广州,510640 华南师范大学生物技术学院,广州,510640

关键词: 荔枝;栽培技术;种质资源;遗传多样性

会议名称: 中国园艺学会热带南亚热带果树分会第三届学术研讨会

主办单位: 中国园艺学会

页码: 477-485

摘要: 本研究利用先期获得的荔枝果皮cDNA文库EST序列,通过SSRIT在线检索,从3391条EST序列中,发现305条含有SSR,占整个文库EST的8.99%。利用SSR-ESTS序列共设计100对EST-SSR引物,从96份荔枝种质中选取12个品种的基因组DNA,开展核心引物筛选,共筛选出多态性较好的EST-SSR分子标记30个。全部96份资源共扩出284条带,不同引物的扩增条带在3-18条,平均9.47,其中有282条为多态性带,多态率高达99.30%,每对引物的Nei's基因多样度范围0.186-0.396,香农信息指数范围0.318-0.558。此外,系统聚类分析结果表明,在相似系数0.5525处,可将96份荔枝种质资源分成了8大类群,该8大类群基本与其生态类型和植物学性状特征相符。在此基础上,对荔枝的主栽品种和特殊种质进行鉴别。结果表明,该30个EST-SSR分子标记在不同品种间可产生较清晰可辨的多态性差异,为荔枝品种和种质资源鉴别和鉴定的分子指纹构建奠定了良好基础。

分类号: S667.1`S602.4

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