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变异型PRRSV-FJ09A株ORF5和NSP2基因的遗传变异分析

文献类型： 会议论文

第一作者： 王隆柏

作者： 王隆柏 1 ; 车勇良 2 ; 吴学敏 1 ; 陈如敬 2 ; 刘玉涛 1 ; 魏宏 2 ; 庄向生 1 ; 周伦江 2 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所,福州350013

2.福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心,福州350013

关键词： 猪繁殖与呼吸综合征;病毒检测;基因序列;遗传变异

会议名称： 福建省科协第十二届学术年会畜牧兽医分会暨福建省畜牧兽医学会2012年学术年会

主办单位： 福建省科协;福建省畜牧兽医学会

页码： 93-98

摘要： 为了解PRRSV-FJ09A福建分离毒株的变异情况,采用RT-PCR方法,对该毒株的ORF5与NSP2基因组进行了遗传变异分析.结果:与PRRSV-VR2332标准毒株比较,基因片段变异程度较大,ORF5的核苷酸及推导的氨基酸的同源性分别为87.6％和88.1％,存在多个氨基酸发生突变,主要集中在抗原表位、毒力相关位点和糖基化位点序列中；NSP2基因的核苷酸及推导的氨基酸的同源性分别为80.9％和77.0％,分3处共缺失了31个氨基酸,比国内其他报道变异型PRRSV毒株多1处缺1个苯丙氨酸(F).比较国内2006年后流行的变异型PRRSV毒株,PRRSV-FJ09A毒株ORF5的核苷酸及推导的氨基酸的同源性分别为98.5％-99.7％和97.5％-99.5％,NSP2基因的核苷酸及推导的氨基酸的同源性分别为98.4％-99.3％和97.3％-98.9％.遗传进化树表明:PRRSV-FJ09A毒株为美洲型毒株,与国内流行的变异型PRRSV-FJ06A毒株的亲缘关系比较近.

分类号： S858.28:S855

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