您好,欢迎访问福建省农业科学院 机构知识库!

番鸭小鹅瘟弱毒D株NS蛋白抗原位点特征分析

文献类型: 会议论文

第一作者: 王劭

作者: 王劭 1 ; 程晓霞 2 ; 陈少莺 1 ; 朱小丽 2 ; 陈仕龙 1 ; 林锋强 2 ; 李兆龙 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所 福州 福建 350013

2.福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心 福州 福建 350013

关键词: 番鸭小鹅瘟病;抗原表位;基因序列;生物信息技术

会议名称: 福建省科协第十三届学术年会分会场——福建省畜牧兽医学术年会

主办单位: 福建省科协;福建省畜牧兽医学会

页码: 54-62

摘要: 为了获得番鸭(Cairina moschata)小鹅瘟病毒(Goose parvovirus,GPV)弱毒株(MDGPV-D)非结构蛋白NS基因的相关信息,根据已发表的MDGPV-PT株全基因序列,应用DNAStar分子生物学软件设计一对引物,采用高保真PCR技术扩增MDGPV-D株NS全基因序列.本研究对番鸭小鹅瘟病毒疫苗弱毒D株(MDGPV-D)NS基因进行克隆、测序并利用生物信息学技术分析MDGPV-D株NS蛋白的同源性、遗传衍化、N-糖基化位点、磷酸化位点、B细胞抗原表位、T细胞抗原表位及其二级结构.结果表明,D株NS全基因大小为1884 bp,编码627个氨基酸(GenBank登录号:JF926696),与MDPV NS基因的亲缘性最近核苷酸及其推导氨基酸同源性分别为97.9-98.6%, 97.6-98.2%; MDGPV-D株NS蛋白具有3个潜在的N-糖基化位点和27个磷酸化位点,可能存在1 1个B细胞抗原表位,13个CD8+CTL表位,10个CD4+Th抗原表位;二级结构分析显示,α螺旋和无规则卷曲含量高,分别为40.67%,41.15%,而β转角仅占4.63%.与亲本强毒PT株相比,弱毒D株的NS蛋白存在2个定点突变,分别位于核苷三磷酸区域(第338位氨基酸)与CD4+Th抗原表位(第225位氨基酸).本研究结果为进一步阐释MDGPV致弱的分子机理提供依据.

分类号: S858.3:S855.3

  • 相关文献

[1]番鸭小鹅瘟病胶乳凝集试验与病毒分离的比较研究. 朱小丽,林锋强,陈少莺,程晓霞,王燕玲,陈仕龙,王劭,李兆龙. 2012

[2]应用胶乳凝集技术诊断番鸭小鹅瘟病. 朱小丽,陈少莺,林锋强,程晓霞,陈仕龙,黄梅清,王劭,李兆龙. 2012

[3]应用胶乳凝集技术诊断番鸭小鹅瘟病. 朱小丽,陈少莺,林锋强,程晓霞,陈仕龙. 2012

[4]福建省新型鸭呼肠孤病毒生物学特性及基因序列分析. 董慧,陈小丽,朱小丽,王劲,林锋强. 2024

[5]PRRSV N与GP5蛋白抗原表位的串联表达及其间接ELISA检测方法的建立. 陈如敬,周伦江,吴学敏,车勇良,王晨燕,王隆柏,黄晓凤,严山,刘玉涛,魏宏. 2017

[6]猪繁殖与呼吸综合征病毒抗原表位研究进展. 陈如敬,周伦江,吴学敏,车勇良,严山,王晨燕,王隆柏,刘玉涛,魏宏. 2016

[7]PRRSV GP5抗原表位的串联表达及生物学活性鉴定. 陈如敬,吴学敏,车勇良,王隆柏,刘玉涛,严山,魏宏,周伦江. 2014

[8]番鸭小鹅瘟弱毒D株NS蛋白抗原位点特征分析. 王劭,程晓霞,陈少莺,朱小丽,陈仕龙,林锋强,李兆龙. 2013

[9]变异型PRRSV-FJ09A株ORF5和NSP2基因的遗传变异分析. 王隆柏,车勇良,吴学敏,陈如敬,刘玉涛,魏宏,庄向生,周伦江. 2012

[10]福建黄兔促卵泡素β亚基cDNA序列的克隆与序列分析. 桑雷,孙世坤,陈冬金,陈岩峰,谢喜平. 2013

[11]CSFV SIV PCV2 PRV和PRRSV多重PCR检测方法的建立及初步应用. 李兆龙,LI Zhao-long,Huang Mei-qing,黄梅清,CHENG Xiao-xia. 2013

作者其他论文 更多>>