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番鸭小鹅瘟弱毒D株NS蛋白抗原位点特征分析

文献类型： 会议论文

第一作者： 王劭

作者： 王劭 1 ; 程晓霞 2 ; 陈少莺 1 ; 朱小丽 2 ; 陈仕龙 1 ; 林锋强 2 ; 李兆龙 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所 福州 福建 350013

2.福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心 福州 福建 350013

关键词： 番鸭小鹅瘟病;抗原表位;基因序列;生物信息技术

会议名称： 福建省科协第十三届学术年会分会场——福建省畜牧兽医学术年会

主办单位： 福建省科协;福建省畜牧兽医学会

页码： 54-62

摘要： 为了获得番鸭(Cairina moschata)小鹅瘟病毒(Goose parvovirus,GPV)弱毒株(MDGPV-D)非结构蛋白NS基因的相关信息,根据已发表的MDGPV-PT株全基因序列,应用DNAStar分子生物学软件设计一对引物,采用高保真PCR技术扩增MDGPV-D株NS全基因序列.本研究对番鸭小鹅瘟病毒疫苗弱毒D株(MDGPV-D)NS基因进行克隆、测序并利用生物信息学技术分析MDGPV-D株NS蛋白的同源性、遗传衍化、N-糖基化位点、磷酸化位点、B细胞抗原表位、T细胞抗原表位及其二级结构.结果表明,D株NS全基因大小为1884 bp,编码627个氨基酸(GenBank登录号:JF926696),与MDPV NS基因的亲缘性最近核苷酸及其推导氨基酸同源性分别为97.9-98.6％, 97.6-98.2％; MDGPV-D株NS蛋白具有3个潜在的N-糖基化位点和27个磷酸化位点,可能存在1 1个B细胞抗原表位,13个CD8+CTL表位,10个CD4+Th抗原表位;二级结构分析显示,α螺旋和无规则卷曲含量高,分别为40.67％,41.15％,而β转角仅占4.63％.与亲本强毒PT株相比,弱毒D株的NS蛋白存在2个定点突变,分别位于核苷三磷酸区域(第338位氨基酸)与CD4+Th抗原表位(第225位氨基酸).本研究结果为进一步阐释MDGPV致弱的分子机理提供依据.

分类号： S858.3:S855.3

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