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甘薯EST-SSR引物开发及有效性检测

文献类型： 会议论文

第一作者： 罗忠霞

作者： 罗忠霞 1 ; 房伯平 1 ; 王章英 1 ; 李俊 1 ; 陈新亮 1 ; 黄立飞 1 ; 陈景益 1 ; 张雄坚 1 ; 李育军 1 ;

作者机构： 1.广东省农科院作物研究所,广东广州510640

关键词： 甘薯;良种选育;EST-SSR引物;分子标记

会议名称： 广东省作物学会、广东省蔬菜产业协会2011年学术研讨会

主办单位： 广东省作物学会;广东省蔬菜产业协会

页码： 94-98

摘要： 甘薯是重要的粮食、饲料、工业原料及新型能源用块根作物，在我国仅次于水稻、小麦和玉米而成为第四大粮食作物。分子标记技术是分子生物学领域一项重要的研究技术，它能最大限度地摆脱外界环境的干扰，准确地对样本进行分析;而且操作简单，结果重复性好。大规模开发有效DNA标记，加强分子标记在甘薯各研究领域中的应用，是提高甘薯分子育种效率的有效途径。本文在本课题组前期对甘薯[Ipomoea batatas(L.)lain.]栽培种大规模测序的基础上,整合公共数据库中现有的甘薯栽培种EST序列,先后共设计了1381对EST-SSR引物.利用杂交亲本品种鄂薯3号和广薯2K-30对其进行有效性检测和多态性分析,共获得1158对有效EST-SSR引物,其中198对在两品种间具多态性.多态性引物在150-200bp(产物长度)间和51-54℃(Tm值)间表现的更加集中,分别比总引物和有效引物平均高出7％和6.4％以上.

分类号： S531.03

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