文献类型： 会议论文
第一作者： 翟少伦
作者： 翟少伦 1 ; 魏文康 2 ; 李小鹏 3 ; 温肖会 2 ;
作者机构： 1.广东省农业科学院动物卫生研究所动物疫病诊断中心/广东省畜禽疫病防治重点实验室,广东广州510640
2.美国南达科达州立大学生物学与微生物学系,布鲁金斯57007
3.美国南达科达州立大学兽医与生物医学系,布鲁金斯57007
关键词： 猪丁型冠状病毒;遗传进化;流行特征;选择性序列分析;华南地区
会议名称： 第25届广东省科技进步活动月——畜牧兽医学术与科技创新发展大会
主办单位： 广东省畜牧兽医学会
页码： 00000035-00000042
摘要： 2012年,猪丁型冠状病毒(PDCoV)首次在香港发现.2014年,PDCoV首次在美国的患腹泻仔猪粪便中得以分离,此后,中国一些省份也报道了该病毒的流行.但其在华南地区的流行现状仍不清楚.华南地区是中国生猪养殖及猪肉消费重要地区.调查其流行以及比较其与传统病毒腹泻病原(猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒和猪C型轮状病毒)的流行情况,有助于防控生猪养殖过程中发生的病毒性腹泻疫病.在本研究中,收集了三个猪场(分别来自广东、广西、海南)的90份临床腹泻样本(每个猪场30份样本,哺乳仔猪、保育猪、育肥猪各10份),并进行了RT-PCR检测.PDCoV主要集中在保育猪,检出率为4.4％(4/90),尽管检出率低,但三个猪场均有阳性.此外,PEDV的检出率为17.8％(16/90),PEDV的流行在猪群日龄上无明显差异,主要集中在哺乳仔猪和保育猪,且与PDCoV混合感染严重.90份样本中未检出猪传染性胃肠炎病毒和猪C型轮状病毒.进一步对PDCoV的S基因和N基因进行克隆和分析,获得的4株PDCoV的S基因和N基因全长为3480bp和1029bp.值得注意的是,PDCoV华南株S基因比美国株以及韩国株的S基因缺失3个碱基.遗传进化分析也表明,PDCoV华南株在一个小分支上,而与美国株、韩国株遗传距离较远.该研究证实了PDCoV在华南地区的存在,并得出了PDCoV华南株在遗传进化上具有一定的地域局限性.
分类号： S858.28:S855.3
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