文献类型： 会议论文
第一作者： Chang Xinjian
作者： Chang Xinjian 1 ; 常新见 2 ; 周金柱 1 ; Zhou Jinzhu 3 ; Lu Tianyi 1 ; 鲁天弈 1 ; Fan Baochao 1 ; 范宝超 2 ; Guo Rongli 1 ; 郭容利 4 ;
作者机构： 1.江苏省农业科学院 兽医研究所,江苏 南京210014
2.西藏农牧学院 动物科学学院,林芝 860000
3.南京农业大学 动物医学院,江苏 南京210014
4.江苏省农业科学院 兽医研究所,
关键词： 猪轮状病毒;VP7基因;VP4基因;基因序列;核苷酸同源性;氨基酸同源性
会议名称： 江苏省畜牧兽医学会首届“青年科技论坛”
主办单位： 江苏省畜牧兽医学会
页码： 00000548-00000562
摘要： 采集2017-2018年华东地区包括江苏、浙江、上海、山东、安徽等省,部分猪场猪的粪便拭子共201份,RT-PCR检测PoRV阳性52份,阳性率25.9％.选择5个阳性样本进行VP7和VP4基因全长扩增并克隆测序,应用DNAStar、MEGA5等生物学软件对其进行比对分析.5个VP7核苷酸序列全长均为1062bp,5个VP4序列全长均为2362bp.VP7基因与不同G型代表株的核苷酸同源性和氨基酸同源性分别为74.1％-94.4％和77.3％-99.7％,与2008年分离的G9型代表毒株NMTL的核苷酸同源性和氨基酸同源性分别为93.2％-95.2％和97.2％-97.5％,但是与G5P7型代表毒株OSU的核苷酸同源性较低,仅为77.3％-77.6％和81.6％-82.8％.VP4与不同P型代表株的核苷酸同源性和氨基酸同源性分别为62.9％-99.4％和60.1％-98.7％,与OSU毒株的核苷酸同源性和氨基酸同源性分别为98.5％-98.7％和99.3％-99.4％.经分析这5株猪轮状病毒的基因型鉴定为G9P7.与参考毒株相比,VP7氨基酸第100、122、180、309位有突变,但无插入和缺失现象,VP4氨基酸在30、137、686、774位有突变,但无插入和缺失.猪轮状病毒流行病学的调查,有助于掌握华东地区的PORV的流行情况.分析临床PoRV对应的两个抗原序列VP7和VP4的基因型,丰富了VP7和VP4基因库.
分类号： S852.651
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