专利类型: 中国发明申请
专利权人: 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所
发明人: 匡友谊;孙效文;尹家胜
专利号: CN200710144577.X
摘要: DNA测序污染序列批量处理工具,涉及到一种分子生物学DNA序列的处理方法。它解决了现有的分子生物学DNA序列的处理方法不能对DNA序列的污染序列进行批量处理的问题。DNA测序污染序列批量处理工具由目录遍历装置、序列文件合并装置、载体污染序列搜索装置、接头污染序列搜索装置、位置确定装置和污染序列去除装置组成。它利用NCBI发布的Blast序列相似性搜索技术将待处理序列在构建好的载体序列库中进行相似性搜索,查找载体序列的位置,自动去除载体序列后,再利用两两序列比对技术查找接头序列的位置,并自动去除接头序列,最终获得无污染序列(包括载体和接头序列)的物种自有的DNA序列。它能够应用到分子生物学领域中对DNA测序获得的序列的处理中。
- 相关文献
作者其他论文 更多>>
-
不同养殖群体方正银鲫的肌肉营养成分析与评价
作者:周慧杰;孙志鹏;闫婷;徐欢;张婷婷;何立川;陈丽梅;匡友谊
关键词:方正银鲫;基本营养成分;氨基酸;脂肪酸;肌肉营养价值
-
高温胁迫对哲罗鲑鳃和肝脏组织病理学及血清生化指标的影响
作者:张潭;佟广香;徐欢;闫婷;卫明亮;张婷婷;匡友谊
关键词:哲罗鲑;高温胁迫;呼吸频率;组织病理学;血清生化指标
-
黑龙江茴鱼对几种常用消毒药物和麻醉剂的耐受性
作者:马凯;朱晓磊;张澜澜;卫明亮;赵成;何宝全;尹家胜;张永泉
关键词:黑龙江茴鱼;消毒药物;麻醉剂;耐受性
-
哲罗鲑种质资源的形态特征比较
作者:马凯;佟广香;张澜澜;郑先虎;赵成;何宝全;尹家胜;张永泉
关键词:哲罗鲑;种质资源;形态差异
-
4种茴鱼属鱼类形态差异比较
作者:马凯;佟广香;张澜澜;孙慧智;卫明亮;赵成;何宝全;尹家胜;张永泉
关键词:黑龙江茴鱼;北极茴鱼;下游黑龙江茴鱼;鸭绿江茴鱼;形态差异
-
斑马鱼脊椎成骨细胞系的建立
作者:闫婷;刘天奇;佟广香;徐欢;张婷婷;匡友谊
关键词:斑马鱼;成骨细胞;细胞系
-
感染水霉病的黑斑原皮肤的组织结构和Toll-like受体及其相关信号通路基因在皮肤中的表达
作者:张颖;吕伟华;马波;佟广香;尹家胜;周建设;李宝海
关键词:黑斑原■;皮肤;水霉菌;Tolling-like受体信号通路


