专利类型： 中国发明申请
专利权人： 中国水产科学研究院
发明人： 李炯棠;薛尉;汪金兔;祝雅萍;孙效文
专利号： CN201210256904.1
摘要： 本发明涉及一种利用长转录组测序结果装配基因组的方法及装置，该方法是将同一物种的转录组测序读段与基因组片段进行比对，去除仅比对到1个基因组片段的转录组测序读段，对保留下来的转录组测序读段上的查询区段以规定条件进行筛选，然后按照规定条件获得与保留下来的查询区段相关的区段连接，基于该区段连接对基因组片段进行连接，从而完成对基因组序列的组装。根据本发明的利用长转录组测序结果装配基因组的方法，能够利用长片段测序数据，包括现有公开的大量Sanger数据，从而能够利用长的转录组测序读段来组装基因组序列。
- 相关文献
作者其他论文 更多>>
-
鲤上皮瘤细胞两种转染试剂的条件优化及应用
作者：李尚琪;徐梓明;赵然;孙晓晴;张研;李炯棠
关键词：鲤上皮瘤细胞;细胞转染效率;高不饱和脂肪酸生物合成
-
金边鲤群体的遗传结构及个体间遗传差异的QTL标记分析
作者：鲁翠云;杜雪松;郑先虎;李超;程磊;孙志鹏;孙效文;陈忠
关键词：金边鲤（Cyprinus carpio var. Jinbian）;QTL标记;遗传结构;遗传距离
-
低氧胁迫对鲫生理状态的影响
作者：蔡超;尤宏争;匡友谊;姜巨峰;郑先虎;孙效文;李春艳
关键词：鲫;低氧胁迫;能量代谢;酶活力
-
转化生长因子-β(TGF-β)基因家族在水产养殖中的潜在应用价值
作者：鲁翠云;匡友谊;郑先虎;孙志鹏;孙效文
关键词：转化生长因子-β基因家族;水产养殖业;应用价值
-
基于转录组数据的溪红点鲑微卫星标记筛选及引进群体遗传结构
作者：郑先虎;鲁翠云;孙志鹏;党红阳;匡友谊;曹顶臣;白庆利;孙效文
关键词：溪红点鲑;转录组;微卫星标记;引进群体;遗传结构
-
利用CRISPR/Cas9技术构建表达鲤长链脂肪酸延长酶5基因(Elovl5)的转基因斑马鱼
作者：王雅欣;杨晨茹;赵宇杰;孙晓晴;李尚琪;张研;刘英杰;李炯棠
关键词：长链脂肪酸延长酶5(Elovl5);CRISPR/Cas9;基因敲入;鲤;高不饱和脂肪酸
-
鲤生长速率性状的QTL定位分析
作者：张晓峰;李超;鲁翠云;郑先虎;匡友谊;曹顶臣;孙效文
关键词：鲤;生长速率;QTL分析;分子标记辅助选择
