科研产出
基于代理程序快速开发生物信息二次数据库
《江苏农业科学 》 2008 北大核心
摘要：以构建鸡基因组全序列二次数据库为例,探讨Windows操作系统下,编译Web代理程序,快速开发生物信息二次数据库的一般过程。研究通用代理程序开发本地化生物信息二次数据库的具体步骤,所涉及的关键技术以及常见问题解决。解决了海量生物信息自动下载与处理问题,经反复调试实现了示例程序鸡基因组全序列二级数据库系统的快速构建。
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水稻条纹病毒编码蛋白在灰飞虱体内的检测及其与CP体外结合研究
《中国农业科学 》 2008 北大核心 CSCD
摘要：【目的】检测灰飞虱体内由水稻条纹病毒(RSV)编码的外壳蛋白(CP)、病害特异性蛋白(SP),以及非结构蛋白NS2、NS3和NSvc4等5种蛋白以及病毒粒子CP与SP、NS2、NS3、NSvc4的体外结合,为进一步研究水稻条纹病毒与其介体昆虫互作提供有用信息。【方法】提取高带毒灰飞虱(Q家系)总蛋白,用免疫方法检测昆虫体内CP、SP、NS2、NS3和NSvc4等5种重要蛋白的表达以及病毒粒子CP与SP、NS2、NS3、NSvc4的体外结合情况。【结果】结果表明在带毒灰飞虱体内以上5种蛋白都能检测到,而且CP含量最高,NSvc4、SP、NS3、NS2含量依次降低;用体外原核表达后纯化的蛋白进行了RSV粒子CP与SP、NS2、NS3、NSvc4的体外结合实验,实验结果表明病毒粒子CP与SP、NSvc4之间存在体外结合关系。【结论】检测结果为灰飞虱作为RSV的昆虫寄主并且可以在其体内增殖的结论提供了支持,表达差异表明病毒编码蛋白在介体灰飞虱体内可能存在着一定的协调关系;病毒粒子与SP的结合为前人关于CP与SP可能共同作用于叶绿体进而影响症状的严重度的报道又提供了一个新的证据,病毒粒子与NSvc4之间存在体外结合关系,也为NSvc4可能作为运动蛋白通过与CP的互作以及诱导病毒在胞间运动需要CP的辅助提供了佐证。
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江苏省不同播期组普通玉米育种性状分析
《江苏农业学报 》 2008 北大核心 CSCD
摘要：研究了2000~2007年江苏省春播、夏播普通玉米区域试验参试组合的农艺性状与产量的关系,结果表明不同播期组玉米的农艺性状对产量的影响不同。相关分析结果表明,春播玉米产量与穗长、每行粒数和出籽率呈显著或极显著正相关,而与秃顶长度呈极显著负相关;夏播玉米产量与株高、穗位高度、穗长、行粒数和千粒重呈显著或极显著正相关,而与秃顶长度也呈极显著负相关。对产量的通径分析结果表明,春播组玉米的穗长、穗粗、秃顶长度、行粒数和千粒重的回归系数与0差异显著或极显著;夏播组玉米的株高、秃顶长度、穗行数、行粒数和千粒重的回归系数与0差异显著或极显著。在选育自交系和配制杂交组合时要特别注意行粒数的正选择和秃顶长度的负选择。
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两个与盐和赤霉病菌胁迫相关的小麦糖基转移酶基因的克隆与表达
《遗传 》 2008 北大核心 CSCD
摘要：在植物体内,糖基转移酶通过参与多种物质的糖基化而在植物抗逆境方面起着重要作用。为了解小麦糖基转移酶基因响应病原菌和盐胁迫的分子机制,文章分离了两个小麦糖基转移酶基因(TaUGT1,TaUGT2)。这两个基因均编码496个氨基酸,cDNA序列相似性为90%。它们均含有一个内含子,分别为335bp(TaUGT1)和324bp(TaUGT2)。序列比对分析表明,TaUGT1和TaUGT2与尿苷二磷酸葡萄糖醛酸/尿苷二磷酸葡萄糖转移酶(UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase)基因同源性最高,且都含有PSPG(Putative secondary plant glycosyltransferase)保守结构域。Real-time PCR表达分析显示,TaUGT1受赤霉病菌抑制表达,而TaUGT2受赤霉病菌诱导表达;在高浓度NaCl胁迫下,TaUGT1和TaUGT2的相对表达量分别为对照的2.87及4.56倍,差异达到极显著水平。以上结果表明,TaUGT2可能与小麦赤霉病抗性有关,而TaUGT1和TaUGT2可能共同参与了小麦对盐胁迫的响应。
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家鸡Mx基因多态性及其诱变修饰的研究
《中国家禽 》 2008 北大核心
摘要：研究采用错配PCR-RFLP的方法对家鸡14个品种的Mx基因变异性分布进行了探索;并利用PCR突变技术将Mx基因全长cDNA第2032位碱基由G突变为A(即631位氨基酸的改变),并将突变的Mx基因插入真核表达载体pcDNA3.0,转染COS-Ⅰ细胞,进行RT-PCR与间接免疫荧光(IFA)鉴定,研究结果显示,14个品种Mx基因的2032位点存在2个等位基因(A、G),3种基因型(AA、AG、GG),其中鹿苑鸡、狼山鸡、斗鸡未发现AA型个体,茶花鸡未发现GG个体;并成功对Mx基因进行PCR诱变修饰和构建了能够表达鸡Mx基因的重组真核表达载体,为其体内外表达及生物学活性的进一步研究奠定了基础。
关键词： 鸡 Mx基因 抗病性 限制性片段长度多态性
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兔出血症病毒衣壳蛋白在昆虫细胞中的表达及对家兔的免疫保护效果
《畜牧兽医学报 》 2008 北大核心 CSCD
摘要：用RT-PCR方法扩增兔出血症病毒(RHDV)衣壳蛋白VP60基因,通过克隆、转化得到重组穿梭载体Bac-mid-VP60,用此质粒转染Sf9昆虫细胞,得到重组病毒rAcV-Bac-VP60,经RT-PCR、IFA、SDS-PAGE、Westernblotting、HA和HI鉴定,结果显示重组VP60蛋白在Sf9昆虫细胞中得到表达。在不加任何佐剂的情况下,用表达的蛋白免疫3月龄非RHD免疫兔,结果显示,免疫后21天,兔体内可产生抗RHDV抗体,抗体血凝抑制效价为26~27,该抗体可以抵抗血凝效价为210致死剂量RHDV强毒的攻击,本研究为兔病毒性出血症基因工程疫苗的研制奠定了基础。
关键词： 兔出血症病毒 衣壳蛋白 杆状病毒表达系统 重组杆状病毒 表达 免疫
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