科研产出
肠道菌群与宿主细胞相互作用模型研究进展
《中华预防医学杂志 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：肠道微生物在人类健康中扮演着重要角色,多种临床疾病如肥胖、糖尿病和心血管疾病等的发生发展均与肠道菌群失衡密切相关.随着高通量测序技术的发展,人们对肠道微生物的认识有了突破性的进展,宿主肠道上皮细胞与肠道微生物间的相互作用已成为当前研究的热点和难点之一.由于动物试验受到伦理审查、实验成本等因素制约,人们对开发体外肠道菌群与宿主细胞相互作用模型愈加感兴趣.本文对最新肠道菌(群)?肠道上皮细胞相互作用模型,以及其工作原理与应用前景进行综述,希望能为肠道菌(群)功能研究提供新技术和新思路.
关键词： 肠道菌群 肠道上皮细胞 细胞?细菌相互作用模型
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不同颜色透光膜对杨梅光合特性和果实品质的影响
《果树学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：【目的】探究不同颜色透光膜对杨梅叶片光合特性和果实品质的影响。【方法】以‘东魁’杨梅为试验材料,设置覆盖红色、蓝色、黄色、绿色、白色等透光膜以及露地栽培等6种处理,测定透光膜的光谱透射比、棚内与露地杨梅叶片光合特性和果实品质等相关指标,利用主成分分析法对不同颜色透光膜的作用进行综合评价。【结果】绿膜和黄膜处理的净光合速率显著高于对照,红膜处理的叶片中N、P、K含量以及果实中多酚含量最高,蓝膜处理的果实单果质量、纵径和横径最大,果实可滴定酸含量最低,黄膜处理的可溶性固形物含量、可溶性糖含量、糖酸比最高,绿膜处理的黄酮含量最高。同时根据主成分分析法得出不同处理的排名顺序为:蓝色、红色、绿色、黄色、对照、白色透光膜。【结论】蓝色和红色透光膜覆盖有利于提高叶片对矿质元素的吸收以及果实品质的提升,适合运用在杨梅的设施栽培中,同时为优质高效生产提供可靠的技术支撑。
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浙江省主要地方鸡品种遗传多样性分析
《农业生物技术学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：地方鸡(Gallus gallus)品种是我国禽类遗传资源的重要组成部分.浙江省养鸡历史悠久,拥有众多鸡品种遗传资源,为研究浙江省主要鸡品种遗传多样性和遗传结构,促进不同鸡品种资源的保护以及合理的开发利用,本研究利用短串联重复序列(short tandem repeats, STR)分型技术对鹊山鸡、仙居鸡、萧山鸡、丝羽乌骨鸡、龙游麻鸡和白耳黄鸡6个鸡品种(共358只)在26个微卫星位点上进行了遗传多样性检测.结果显示,在6个群体的26个位点共检测到153个有效等位基因,平均有效等位基因数(effective number of alleles, Ne)为5.906 9,期望杂合度(expected heterozygousity, He)为0.795 9,基因流(gene flow,Nm)为2.007,Shannon信息指数I为1.925 1,多态信息含量(polymorphism information content, PIC)在0.24~0.87之间.Nei氏遗传距离结果显示,6个群体间的Nei氏遗传距离为0.103 5~0.380 9;其中,鹊山鸡与萧山鸡的遗传距离最大(数值为0.3809),鹊山鸡和白耳黄鸡的遗传距离次之(数值为0.1072),龙游麻鸡和仙居鸡的遗传距离最小(数值为0.1035).聚类分析结果显示,鹊山鸡与白耳黄鸡、仙居鸡与龙游麻鸡分别聚为一类.6个群体均具有较高的遗传多样性,其中白耳黄鸡的遗传多样性最高,丝羽乌骨鸡的遗传多样性最低,鹊山鸡与其他鸡品种的相似性顺序由高至低依次为白耳黄鸡、丝羽乌骨鸡、龙游麻鸡、仙居鸡、萧山鸡.本研究通过对浙江省境内6个鸡品种的遗传多样性分析,进一步完善了浙江省主要鸡品种的遗传结构,为鸡遗传资源的保护及开发利用提供了基础资料.
关键词： 地方鸡种 遗传多样性 遗传距离 短串联重复序列(STR)
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辣椒遗传图谱的构建及主要农艺性状QTL定位的研究进展
《分子植物育种 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：辣椒是中国重要的蔬菜作物之一,其遗传和育种一直受到研究人员的重视.遗传图谱是基因定位、图位克隆和分子辅助育种的有力工具.近十年来,随着生物信息学的发展和分子标记的开发应用,通过简化基因组测序技术以及高通量测序开发的SNP标记的应用,使得辣椒遗传图谱的精确度越来越高.本文对辣椒遗传图谱构建研究进展进行综述,总结了近年来辣椒主要农艺性状QTL定位,并阐明了当前辣椒研究中的主要问题和发展趋势,以期对今后中国辣椒分子标记辅助选择育种提供理论依据.
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基于NIR和PLS-DA法的东北大米产地快速溯源方法研究
《中国粮油学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：鉴于市场上东北大米掺伪和假冒现象频发,本研究将近红外光谱技术与PLS-DA判别法相结合用于东北大米产地快速溯源。实验共收集75份大米样本(52份东北产地大米,23份非东北产地大米),按照4∶1的比例随机划分得到训练集样本60份和测试集15份。为消除品种、颗粒形态等对近红外光谱和产地鉴别的影响,实验比较多种光谱预处理方法,并根据相关系数值确定了矢量归一化为首选的预处理方法;将矢量归一化预处理后的光谱按照吸收峰分4个区间分别建立东北大米产地PLS-DA模型,其中4 000～5 500cm~(-1)谱区建立产地溯源模型,训练集准确率可达93.33%,测试集准确率为86.67%。实验结果表明,近红外光谱与PLS-DA法结合在东北大米产地快速溯源技术领域有着光明的应用前景。
关键词： 产地溯源 近红外光谱 偏最小二乘判别分析 矢量归一化 东北大米
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不同消毒剂处理对冷鲜鸡肉微生物的抑菌效果研究
《畜牧与兽医 》 2019 北大核心
摘要：旨在通过观察不同消毒剂对于冷鲜鸡肉胴体进行预处理后肉品质和微生物的变化,找出冷鲜鸡肉生产最佳的消毒剂类型.采用健康、体重相近的120日龄三黄鸡75只,随机分成3组,即:无消毒剂组(XD1)、次氯酸钠组(XD2)和二氧化氯组(XD3),确保全程冷链加工运输、2~4℃贮存,并在第1、3、5、7、9天采样分析,动态监测冷鲜鸡肉的肉质品质、理化指标和胸肌中微生物的变化.结果:经过这2种消毒剂处理后的鸡肉胴体品质随时间变化未见显著差异(P>0.05),仅肉色a*指标在第3天后出现显著差异(P<0.05),而对于pH等其他肉质指标未见显著影响(P>0.05);挥发性盐基氮(TVB-N)含量在第5天时极显著低于对照组(P<0.01);微生物种类检测表明对于肉质影响的主要微生物菌群为Proteobacteria,该类菌群在冷鲜鸡肉中的含量随时间推移呈现显著上升趋势,但是在次氯酸钠组的上升速率最低、二氧化氯次之.次氯酸钠组第9天的Proteobacteria类菌群数量只有对照组第7天的水平,延长货架期效果最明显.本次试验证实,在屠宰加工环节对利用次氯酸钠对冷鲜鸡肉进行消毒预处理,能够保证鸡肉品质无显著变化的基础上延长货架期2 d以上,特别是能够抑制肠道有害菌群的生长.
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家禽屠宰场微生物菌群结构及大肠杆菌耐药性评估
《食品科学 》 2019 EI 北大核心 CSCD
摘要：家禽屠宰场的水体、地面和屠宰器械表面微生物对鸡肉微生物交叉污染有重要的影响。本研究的主要目的是分析家禽屠宰场水体、地面和与鸡肉接触的屠宰器械表面的细菌结构及其耐药基因携带状况,并从中分离大肠杆菌进行耐药性评估和肠杆菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反应(enterobacterial repetitive intergenic consensus polymerase chain reaction,ERIC-PCR)分型分析。在浙江省某大型屠宰场的挂禽间、宰杀沥血间、浸烫脱羽间、净膛间、预冷间、包装间、冷藏间、内脏间区域采集水体,并用无菌纱布擦拭各区域的地面和器械表面采集微生物,基于16S rRNA V3～V4的Illumina高通量测序方法分析其菌群结构多样性,并从中分离大肠杆菌,分别用PCR对总细菌和大肠杆菌进行9大类耐药基因的检测分析和大肠杆菌的ERIC-PCR分型研究。结果表明:屠宰场不同区域水体、地面和屠宰器械表面微生物均以变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和放线菌门(Actinobacteria)为主;优势菌属为不动杆菌属(Acinetobacter)、链球菌属(Streptococcus)、嗜冷杆菌属(Psychrobacter)和假单胞菌属(Pseudomonas)等一些腐败菌属与致病菌属。屠宰场不同区域的水体、地面和屠宰器械表面存在的耐药基因种类较多,共检测到21种耐药基因分布在这些样品中,其中sulI、sulII、blaTEM、aadA1、floR、tetA、ereA和qnrS等8种耐药基因检出率达88.9%以上,与从中分离的大肠杆菌耐药基因检出情况吻合度较低,这表明还存在其他携带耐药基因的菌株,此外分离的大肠杆菌菌株多重耐药现象严重。ERIC-PCR分型结果表明,大肠杆菌可以沿屠宰生产链进行克隆传播。本实验将为探究屠宰环境微生物与鸡肉污染微生物之间的关系提供理论参考。
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两株分离自鸡粪便费格森埃希菌的耐药性
《微生物学通报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：[背景]费格森埃希菌(Escherichia fergusonii)是与大肠杆菌同属、近源的病原菌,目前耐药性鲜有报道.[目的]对在浙江省鸡粪便中分离到的2株费格森埃希菌EFCF053和EFCF056进行耐药性检测和分析.[方法]通过微量肉汤稀释法进行MIC测定,二代高通量测序获得全基因组序列,并通过ResFinder数据库预测获得性耐药基因.利用S1-PFGE和Southernblotting杂交进行质粒和耐药基因的确认.[结果]两种菌均对氨苄西林、庆大霉素、氟苯尼考、磺胺异噁唑、复方新诺明、四环素耐药,其中菌株EFCF056还对粘菌素、头孢噻呋、大观霉素、恩诺沙星、氧氟沙星耐药.预测到耐药基因β-内酰胺类blaTEM-1A、blaCTX-M-65、blaOXA-1、blaTEM-1B、blaCTX-M-55;氨基糖苷类aac(3)-IId、aph(3')-Ia、aph(3'')-Ib、aph(6)-Id、rmtB、aac(6')-Ib-cr、aadA2;粘菌素mcr-1;喹诺酮类qnrS2、aac(6')-Ib-cr、oqxA、oqxB;磷霉素fosA3;大环内酯类mph(A);苯丙醇类catA1、floR、catB3;利福霉素ARR-3;磺胺类sul1、sul2、sul3、dfrA12、dfrA14;四环素类tet(A).另外,含有mcr-1基因的质粒通过实验证实可发生接合转移.[结论]结果显示费格森埃希菌可能是重要耐药基因存储库,费格森埃希菌与大肠埃希菌要在抗药性流行病学中加以区分,深入研究其MIC频率分布、重要耐药基因mcr-1及ESBL等,保障临床检测的准确性.
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杨梅果实发育过程中内源激素的变化与采前落果的关系
《植物生理学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：为了揭示杨梅果实采前落果与内源激素含量变化的关系,以及明确果实发育过程中各种激素的变化规律,以采前落果差异明显的4个品种为试材,在果实发育5个时期中检测了果实和果柄2个部位的4种内源激素赤霉素(GA3)、玉米素(ZT)、吲哚-3-乙酸(IAA)和脱落酸(ABA)的含量.结果表明,在采前落果期,落果较轻的'荸荠种'和'东魁'的果实与果柄中GA3、IAA含量和(GA3+ZT+IAA)/ABA比值都分别极显著高于易落果的'丁岙梅'和'水晶种',而同时期ABA含量、ABA/IAA和ABA/GA3比值的表现相反,表明当GA3和IAA含量、(GA3+ZT+IAA)/ABA比值较低, ABA含量、ABA/IAA比值和ABA/GA3比值较高时,采前落果严重.在4个品种的果柄中ABA/IAA比值变化规律一致,呈"M"形趋势,且品种间存在显著性差异,认为果柄中该指标可作为指示杨梅采前落果的有效指标.
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bZIP转录因子在植物生长发育及非生物逆境响应的作用
《浙江农业学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：在植物的一生中,不同的基因被设定在不同的时期及部位精确地表达,或是在不同的环境条件下如高温、干旱等诱导表达,基因表达受转录因子的精确调控。植物碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)蛋白是一类重要的转录因子,其参与了植物从生长发育到胁迫响应的各种过程。植物生长转变及对胁迫做出响应会迅速地诱发自身大量基因的转录变化,这一过程称为转录重编程。bZIP转录因子就是引导这些转录重编程的转录因子中重要的一类。本文介绍了bZIP转录因子的结构、分类以及重要功能,综述了其在植物生长发育及非生物胁迫响应等过程中所起的关键作用,并就如何拓展完善bZIP转录因子功能研究作了展望。
关键词： bZIP转录因子 生长发育 非生物逆境 转录调控 蛋白互作
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