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木薯AT-hook基序核定位基因家族的全基因组鉴定、表达谱及调控网络分析

热带作物学报 2025 北大核心 CSCD

摘要:AT-Hook基序核定位(AT-hook Motif Nuclear Localized,AHL)蛋白作为植物中广泛存在的调控因子,在植物生长发育调控和逆境胁迫中发挥重要作用.尽管该基因家族在多个植物中已被研究,但木薯(Manihotesculenta)AHL家族的基因组学特征、进化机制及其表达调控模式仍未见报道.本研究基于木薯SC205的参考基因组,通过全基因组鉴定、系统进化分析、基因结构解析以及大规模转录组数据整合,系统揭示MeAHL家族的进化特征、基因表达模式和调控模块.研究共鉴定41个MeAHL基因,其中40个为不稳定蛋白,氨基酸数量介于188~446 aa之间.系统进化分析将其分为Clade A和Clade B两个分支,并在Chr01和Chr02染色体的远端粒区域发现2个MeAHL基因簇.进化机制分析表明全基因组复制(WGD)事件是驱动该家族扩张的主要进化动力.结构域分析显示MeAHL基因含有PPC/DUF296结构域和AT-hook基序:Clade A基因含有单个Type-Ⅰ AT-hook基序,而Clade B基因多具有Type-Ⅰ和Type-Ⅱ双基序.启动子顺式作用元件分析揭示MeAHL基因启动子区富集光响应元件、植物激素响应元件以及生物/非生物胁迫响应元件,暗示其功能多样性.多组织转录组分析显示MeAHL两个分支在11种不同组织中呈现差异表达模式,暗示其亚家族功能分化.非生物/生物胁迫转录组分析表明,部分MeAHL对干旱(ABA/PEG处理)、木薯细菌性萎蔫病(Xanthomonas axonopodispv.manihotis)和螨虫侵害等胁迫具有显著响应,且呈现分支特异性的表达模式.蛋白互作网络分析显示部分MeAHL可与bHLH、NAC、ARF、NB-LRR等参与发育调控和逆境响应相关的蛋白形成功能模块.本研究结果系统解析MeAHL基因家族进化特征与亚家族功能分化,及其响应不同生物学过程的基因表达模式和部分MeAHL的调控模块,为利用该家族基因进行木薯分子育种设计提供理论依据.

关键词: 木薯 AHL基因家族 生物信息学分析 表达分析 调控网络

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橡胶树酵母双杂交文库构建及HbTRXy2互作蛋白筛选

热带作物学报 2025 北大核心 CSCD

摘要:硫氧还蛋白通过催化硫醇-二硫键交换反应调节靶蛋白的结构和功能,在维持细胞氧化还原稳态中发挥关键作用。前期研究证实橡胶树y型硫氧还蛋白HbTRXy2具有很强的抗氧化功能。为探究HbTRXy2调控抗氧化性的分子机制,本研究构建橡胶树酵母双杂交文库及HbTRXy2诱饵载体pGBKT7-HbTRXy2,并通过酵母双杂交筛选与HbTRXy2互作的蛋白。结果显示:本研究构建的次级文库重组率为100%,插入片段平均长度大于1000bp,库容量为3.80×10~6 CFU/mL;经检测,诱饵载体pGBKT7-HbTRXy2在酵母中无毒性和自激活活性,可用于酵母双杂交筛选;采用共转化法从构建的文库中筛选到与HbTRXy2互作的蛋白24个。生物信息学分析表明,这些候选互作蛋白的功能涉及氧化还原、逆境胁迫响应、ATP结合与代谢、卡尔文循环、单碳代谢、碳固定、蛋氨酸生物合成、脂质A生物合成、金属离子结合或转运、跨膜转运、细胞体积调控、磷酸根离子稳态、蛋白质磷酸化和蛋白质折叠等。本研究结果为深入解析HbTRXy2在橡胶树中的功能及其作用机理奠定基础。

关键词: 橡胶树 硫氧还蛋白 酵母双杂交 酵母文库构建 互作蛋白

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复合保存体系HY/NH3对鲜胶乳保存效果及橡胶性能的影响

化工新型材料 2025 北大核心 CSCD

摘要:鲜胶乳是天然生物合成的复杂橡胶-水基型分散体系,极易腐败变质。将均三嗪衍生物(HY)与NH3复合作为鲜胶乳的保存体系,分析复合保存体系HY/NH3对鲜胶乳保存效果及橡胶性能的影响。结果表明:复合保存体系HY/NH3保存胶乳的效果优于NH3;含HY的天然橡胶正硫化时间(t90)相对较短,而硫化胶的物理机械性能更优异。相同保存条件下,与NH3保存样品相比,NY-1、NY-2、NY-3的挥发脂肪酸值较小;NY-2、NY-3保存鲜胶乳96h,其挥发脂肪酸值仍低于0.15;NY-3的门尼黏度、焦烧时间(t10)、t90等最小,但其硫化胶的拉伸强度、撕裂强度最大,比NH3硫化胶分别提高了13.5%和34.9%。

关键词: 复合保存体系HY/NH3 挥发脂肪酸 保存效果 物理机械性能

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黑指纹海兔Aplysia dactylomela中的萜类化合物及其抗炎和细胞毒活性

海洋科学 2025 北大核心 CSCD

摘要:本研究首次以中国三沙市七连屿的黑指纹海兔Aplysia dactylomela为研究对象,对其化学成分及生物活性进行研究。运用硅胶柱层析、Sephadex LH-20凝胶柱层析和半制备型高效液相色谱等分离技术对黑指纹海兔A.dactylomela的次生代谢物进行分离纯化,结合核磁共振波谱和质谱等波谱数据,并与文献数据进行比对,对所分离到的化合物进行结构鉴定。从黑指纹海兔A.dactylomela中分离鉴定了11个化合物,其结构分别鉴定为:palisadin A (1)、(-)-aplysistatin (2)、5β-acetoxypalisadin A (3)、5-acetoxypalisadin B (4)、luzodiol (5)、pileaterpene C (6)、isoaplysin-20 (7)、isoconcinndiol (8)、cis-pachydictyol B (9)、dictytriol (10)和brevisnoside A (11)。其中,化合物1~5、7~8为溴化萜类化合物,化合物6、9~11为萜类化合物。抗炎和细胞毒活性测试结果显示,化合物1~4、6和10均具有不同程度的抗炎活性,且无细胞毒性。其中化合物2(IC50值为(3.42±0.25)μmol/L)的抗炎活性比阳性对照槲皮素的抗炎活性(IC50值为(9.98±1.14)μmol/L)更强。化合物1和4对人慢性髓原白血病细胞(K562)具有中等抑制作用,其IC50值分别为(27.82±0.06)和(19.99±1.96)μmol/L。

关键词: 黑指纹海兔 化学成分 溴化萜类化合物 抗炎活性 细胞毒活性

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不同消毒方法及培养基对获得木棉无菌苗的影响

分子植物育种 2025 北大核心 CSCD

摘要:为获得一种适于木棉组织培养的种子消毒方法和萌发培养基,本研究利用75%乙醇、2%NaClO和15%H2O2组合方法和氯气消毒法对种子进行消毒,观察不同消毒方法和消毒时间对种子消毒效果及萌发率的影响,并测试MS无机盐浓度和碳源对幼苗生长状态的影响,17 d后统计无菌苗的污染率和发芽率,以期获得生长均匀、健康的无菌苗用于下一步组培快繁。研究过程中发现氯气消毒方法简单高效,只需将装有种子的培养皿置于密闭玻璃干燥器中,利用8%Na ClO和36%HCl溶液反应生成氯气对种子进行消毒,结果发现种子的污染率仅为3.33%,萌发率高达78.17%;1/2MS基本培养基添加2%葡萄糖作为碳源则有利于获得健康、翠绿且下胚轴高度均一的无菌苗。本研究最终确立一种步骤简单、操作方便的消毒方法,减少了消毒液对种子的伤害与污染,保证了种子的活力,并获得了一种较好的苗培养基,为高效实施木棉优良种苗组培快繁提供了前期技术基础。

关键词: 木棉 种子消毒 苗培养基 污染率 发芽率

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苏湖肉羊体重和体尺的多元回归分析

中国畜牧杂志 2025 北大核心

摘要:为了分析苏湖肉羊早期生长发育阶段体重和体尺间的相关关系,本试验随机选取309只苏湖肉羊,测定初生、2月龄以及6月龄体重和体尺数据,通过相关分析、通径分析以及回归分析,建立苏湖肉羊不同月龄最优回归模型。结果表明,苏湖肉羊公母羊初生、2月龄和6月龄体重与体长、体高、胸围、胸深、胸宽和管围都呈极显著正相关。影响初生和2月龄公母羊体重的指标主要是体长、体高和胸围,影响6月龄公母羊体重的指标主要是体高和胸深。苏湖肉羊最优回归方程:初生公母羊分别为Y=-6.843+0.060X1+0.052X2+0.147X3(R2=0.862)和Y=-6.923+0.071X1+0.057X2+0.068X3+0.067X4+0.073X5+0.358X6(R2=0.868),2月龄公母羊分别为Y=-33.276+0.297X1+0.562X2+0.186X3(R2=0.704)和Y=-25.552+0.209X1+0.095X2+0.330X3+0.907X6(R2=0.802),6月龄公母羊分别为Y=-48.205+0.528X2+0.860X4+0.654X5(R2=0.747)和Y=-47.012+0.222X1+0.184X2+0.254X3+0.648X4+1.591X6(R2=0.612)。研究表明,在苏湖肉羊选育过程中,应重点加强体高、体长、胸围和胸深等体尺指标的选择,以期达成提高其体重的目的。

关键词: 苏湖肉羊 体重 体尺 回归分析

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海南岛吊罗低地雨林公顷级样地乔木树种多样性及空间分布格局

山东农业大学学报(自然科学版) 2025 北大核心 CSCD

摘要:低地雨林群落是我国热带地区森林类型的重要构成部分,深入探究海南岛低地雨林乔木树种的多样性特征及其空间分布格局,对于海南低地雨林的生态保护具有至关重要的意义。本研究基于在海南吊罗山低地雨林所建立的1 hm2动态监测样地的树种清查数据,对群落的组成结构、多样性特征、优势种空间分布格局以及种间关系进行了深入的分析。结果显示(1)1 hm2动态监测样地内胸径大于3 cm乔木2 074株,共计152种,隶属于106属、43科。(2)优势乔木树种(个体数量大于60),主要为山蒲桃(198株),岭南山竹子(142株),木荷(114株),光叶巴豆(113株)等;稀有种(1株)为50种,占总种数的32.89%。(3)7个优势树种种群的径阶分布为倒“J”型,表明其种群幼龄个体数量较多,种群更新容易,种群正处于增长阶段,未来有较好的发展趋势。(4)优势种的空间分布格局呈现多样性,琼榄和阴香呈现随机分布的特点,然而光叶巴豆以集群分布为主,其他优势种主要呈现为集群分布和随机分布相结合的模式。(5)8个优势种总体上负相关种对和无关联种对多于正相关种对。在0-20 m的尺度上琼榄与多个树种均无显著相关性,而山蒲桃与光叶巴豆及海南锥在该尺度内表现为负相关。基于公顷级样地树种清查结果,海南吊罗山低地雨林群落处于不稳定阶段,种间竞争激烈,排斥竞争较强,群落演替过程中优势物种将频繁更替,为保护海南低地雨林的生物多样性以及生态管理的决策提供了基础依据。

关键词: 海南 低地雨林 树种多样性 种间关系 空间分布格局

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气候变化背景下全球荔枝潜在地理分布模拟预测

中国农业气象 2025 北大核心 CSCD

摘要:基于全球荔枝分布记录、基准时期(1970-2000年)和未来时期(2050s和2090s)不同气候情景的环境变量,利用优化后的MaxEnt最大熵模型分析影响荔枝分布的主要环境变量并预测其潜在地理分布,以期通过预测气候变化对全球荔枝分布格局的影响,为荔枝产业可持续发展提供理论依据。结果表明:(1)影响荔枝分布的最主要环境变量是最冷季度平均温度(bio11),其次是最暖季度降水量(bio18)和最湿季度降水量(bio16),bio11、bio18和bio16在分布概率Q≥50%的变化范围分别为11~22℃、487~1875mm和554~2052mm。(2)相较于基准期,未来时期荔枝潜在分布格局主要变化区域为中国和印度,不同时期荔枝中、高适生区主要分布在中国华南地区,其次为印度和越南,中国华南地区拥有全球最大的高适生区。(3)未来时期,中国华南地区荔枝适生区将向高纬度地区扩张,特别是在SSP5-8.5情景下2090s(2081-2100年)荔枝高、中和低适生区将分别向北扩张2、4和6个纬距;而在同时期同情景下印度的适生区会向西扩张15个经距。(4)在SSP2-4.5情景下,未来时期荔枝总适生区面积显著增加,增加区域主要是低适生区;在SSP5-8.5情景下,荔枝低、中适生区面积表现为减少,其中2090s的低适生区面积最小,但其高适生区面积达到最大,为154.6×10~4km2。(5)全球荔枝分布质心向高纬度偏移,以SSP5-8.5情景下2090s的偏移距离最长,纬度跨度最大。综合分析表明,全球气候变暖造成荔枝适生区北扩,但极端气候事件的频发也对荔枝生境带来严峻挑战,选育气候适宜性广,高抗逆性的优良品种是荔枝产业持续发展的关键。

关键词: 气候变化 荔枝 MaxEnt模型 环境变量 地理分布

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白化菠萝蜜幼苗光合作用相关基因表达分析

热带作物学报 2025 北大核心 CSCD

摘要:光合色素缺失的白化植株是研究光合作用的理想材料。本研究在前期考察时发现白化菠萝蜜幼苗(albino Artocarpus heterophyllus seedlings, AAS)。AAS的叶片较大,存活时间较长,且表型性状稳定,是不可多得的木本白化植物。通过转录组测序分析AAS光合作用相关基因的表达,发现AAS叶光合色素合成、光合作用-天线蛋白、光反应和碳固定反应通路中诸多基因的发生下调表达,质体-核信号通路中关键调控因子heat shock protein 70(HSP70)、heat shockprotein90(HSP90)和HSP70–HSP90-organizingprotein3(HOP3)的编码基因发生上调表达。本研究从光合色素合成途径讨论了AAS的成因,以及从质体-核信号方面探讨了其光合作用相关基因的表达,为该逆行信号通路的探索提供参考。

关键词: 菠萝蜜 白化苗 光合色素 光合作用 基因表达

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基于广泛靶向代谢组学的澳洲坚果果皮和果仁成分差异分析

中国南方果树 2025 北大核心

摘要:为了解澳洲坚果果皮和果仁主要代谢成分,比较澳洲坚果果皮和果仁的成分差异。利用广泛靶向代谢组学对Own Choice澳洲坚果成熟果实果皮和果仁进行测定分析,通过主成分分析(PCA)、正交偏最小二乘—判别分析(OPLS-DA)和聚类分析等多元统计方法对代谢组数据比较分析,筛选差异代谢物。结果表明,供试澳洲坚果果皮和果仁中共检测到20类1 078种代谢物,其中氨基酸及其衍生物、类黄酮、碳水化合物及其衍生物、有机酸及其衍生物和脂质等5类代谢物数量占比较高。根据Log2(FC)≥1且p<0.05筛选差异代谢物,果皮与果仁筛选出差异代谢物552种,其中类黄酮、氨基酸及其衍生物和糖类及其衍生物类化合物占比较多;与果皮相比,果仁中360种差异代谢物上调,192种差异代谢物下调。KEGG富集分析发现,澳洲坚果果皮与果仁的差异代谢物主要富集在不同环境下的微生物代谢、氨基酸生物合成、辅助因子生物合成、核苷酸代谢等途径。澳洲坚果果皮和果仁中具有生物活性和药理活性的代谢物,且在果皮和果仁中代谢物类别和含量存在差异。

关键词: 澳洲坚果 果皮 果仁 广泛靶向代谢组学 差异代谢物

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