科研产出
基于转录组的三月李及其红肉突变体Expansin基因家族鉴定及分析
《福建农业学报 》 2020 CSCD
摘要：[目的]Expansin是广泛存在于植物中的一类细胞壁蛋白,通过调节细胞壁柔韧性在植物生长发育过程中发挥作用.本研究旨在分析Expansin基因家族特征及其在果实成熟过程中的表达模式,并比较Expansin基因在三月李及其红肉突变体之间的差异表达.[方法]基于三月李及其红肉突变体果实成熟过程的转录组数据,采用生物信息学分析方法进行Expansin家族基因鉴定与分析.[结果]鉴定出33个李Expansin基因家族成员,编码蛋白长度在176~460 aa,分子量在19.21~51.33 kD,等电点4.62~9.83,大部分为位于细胞外的稳定亲水蛋白.系统进化树分析表明李Expansin家族成员可分为4个组:22个EXPA、6个EXPB、1个EXPLA和4个EXPLB.所有李Expansin蛋白质均具有保守的DPBB_1和Pollen_allerg_1结构域.保守基序分析表明,同一组Expansin成员具有相似的基序组成.9个Expansin基因在三月李及其红肉突变体果实成熟过程中差异表达.[结论]Expansin在三月李及其红肉突变体果实成熟过程中的表达模式存在显著差异.本研究结果可为解析李Expansin家族基因在果实成熟过程中的功能奠定基础.
关键词： 李 转录组 expansin家族 生物信息学分析 表达分析
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粉杂1号香蕉关键栽培技术
《东南园艺 》 2020
摘要：粉杂1号香蕉以其较高的品质和抗性而备受青睐.本文从建园、育苗、整地、种植、田间管理、防霜冻及病虫害防治等方面,阐述了粉杂1号香蕉的关键栽培技术,为香蕉良种普及提供了理论依据.
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福建省诏安县农作物种质资源调查与分析
《福建农机 》 2020
摘要：首次收集诏安县的10个乡镇总计96种当地农作物种质资源,全面了解诏安县本地农作物资源组成及分布情况,通过种质资源调查与分析,获得地方特异资源38份、野生蔬菜资源4份、野生果树余甘子资源10份,对充分挖掘传统品种资源优势及传统名特优作物品种提纯复壮、改良繁育具有重要意义.
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冬瓜BhMAPK15基因的克隆及其非生物胁迫下的表达分析
《中国细胞生物学学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：该文为探究MAPK15基因的结构和功能,根据冬瓜(Benincasa hispida (Thunb.) Cogn.)转录组高通量测序结果,采用RT-PCR方法从冬瓜中分离得到MAPK15基因的完整编码序列,命名为BhMAPK15.序列分析表明,BhMAPK15开放阅读框(ORF)长1 704 bp,编码567个氨基酸.亚细胞定位预测表明,BhMAPK15可能定位于细胞核或细胞质.以NCBI数据库为基础,从数据库中获得模式植物水稻、拟南芥和其他不同物种间的MAPK15家族成员,分析该基因与这些成员的氨基酸序列、保守基序,并构建系统进化树.经系统进化树分析表明,BhMAPK15属于D组家族成员,与甜瓜、南瓜、黄瓜和苦瓜的相似性较高.氨基酸序列和保守基序结果表明,该基因家族成员保守性较高.实时荧光定量PCR分析表明,BhMAPK15在不同组织器官中均有表达,且非生物胁迫处理可以上调BhMAPK15的表达水平.上述研究结果表明,BhMAPK15基因可能在冬瓜响应非生物胁迫中发挥作用.
关键词： 冬瓜 BhMAPK15 基因克隆 非生物胁迫 表达模式
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福建省科技扶贫长效机制探究-以福建省农业科学院为例
《台湾农业探索 》 2020
摘要：[目的/意义]科技扶贫是中国扶贫开发工作的重要组成部分,文章以福建省农业科学院为例,探讨建立福建省科技扶贫,服务"三农"的长效机制.[方法/过程]针对科技扶贫的特点,总结福建省农业科学院科技扶贫的做法、成效,分析福建省科技扶贫存在的问题并提出相应对策.[结果/结论]结果显示,福建省农业科学院科技扶贫在科技服务推广、项目带动区域支柱产业开发、精准对接基层需求、科技特派员工作、科技培训和扶贫制度保障等方面取得了较好的成效,针对福建省科技扶贫存在项目缺少针对性、实践性技术指导欠缺、扶贫联动机制不够完善、农民扶贫参与度不够高等问题,从科技扶贫的政策导向、项目设立、新型农民培育、扶贫机制、实施保障等5方面提出构建福建省科技扶贫的长效机制.
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闽江河口湿地植物根际土壤氨氧化细菌群落结构分析
《福建农业学报 》 2020 CSCD
摘要：[目的]研究闽江河口湿地不同植物根际土壤中氨氧化细菌群落多样性及结构组成,为阐明湿地植物根际土壤脱氮功能微生物类群研究提供科学数据.[方法]多点混合采样法采集不同季节不同土层闽江河口湿地芦苇、互花米草和红树林根际的土壤样品共24个,通过高通量测序技术测定样品氨单加氧酶编码基因amoA序列,生物信息学方法分析土壤样品氨氧化细菌的群落结构及多样性.[结果]24个样品中共检测到300527条有效序列,2794个OTU.多样性分析结果表明,芦苇、互花米草和红树林根际土壤样品Chao指数差别不大,Shannon指数平均值表现为红树林>芦苇>互花米草;芦苇和红树林根际土壤样品Chao指数和Shannon指数均表现为春季最低;不同土层芦苇、互花米草和红树林根际土壤样品Chao指数和Shannon指数均未呈现出明显的变化趋势.群落结构分析结果表明,闽江河口湿地土壤样品中存在着较多分类地位未确定的氨氧化细菌,而分类地位确定的氨氧化细菌中,优势菌门为变形菌门(Proteobacteria),优势菌属包括亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)、硫杆菌属(Thiobacillus)、Caldimonas属等.[结论]闽江河口湿地植物根际土壤中氨氧化细菌的主要优势菌群大多是亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas),硫杆菌属(Thiobacillus)和Caldimonas属为个别样品的优势菌群.
关键词： 闽江河口湿地 氨氧化细菌 amoA基因 群落结构 高通量测序技术
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山羊地方性鼻内肿瘤病毒ENTV/CH/GT/2015株全基因组cDNA文库的构建及生物信息学分析
《中国兽医学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为获得山羊地方性鼻内肿瘤病毒(ENTV-2)古田株(暂命名为:ENTV/CH/GT/2015株)全基因组序列.通过PCR方法从山羊鼻内肿瘤组织中分段扩增获得ENTV-2全基因组7个片段,目的片段经胶回收后分别连接至pMD19-T载体上,并转化至基因工程菌DH5a,提取阳性质粒进行测序,利用生物学软件对获得的序列进行拼接分析.获得ENTV/CH/GT/2015株全基因组序列长度为7 506 bp,包含相互重叠的gag-pro-pol-env编码区及5′端非编码区,并上传至GenBank上获得登录号为MK210250.1;与国外NC004994.2株和AY197548.2株核苷酸同源性均为87.5%,与国内ENTV-2CHN8株核苷酸同源性为97.7%.氨基酸序列分析结果显示,gag蛋白在124~126 aa插入GVE 3个氨基酸和229~232 aa插入APPP 4个氨基酸,env蛋白在590~593 aa处存在AESL 4个氨基酸的缺失;gag和env蛋白抗原表位分析结果显示,尽管存在氨基酸的突变和缺失,但抗原表位并没有明显差异.糖基化位点预测结果显示:gag、pro、pol和env蛋白分别含有1,1,4,6个糖基化位点,均可能不包含信号肽.遗传进化树分析结果推测,该毒株是国内ENTV-2CHN2株和ENTV-2CHN10株变异毒株.本研究获得ENTV/CH/GT/2015株全基因序列并明确其生物学特性,不仅丰富了ENTV-2全基因序列库,还为今后研究ENTV-2快速检测方法及致病机理提供了研究素材.
关键词： 山羊 地方性鼻内肿瘤病毒 全基因克隆 生物信息学分析
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肉鸽主要寄生虫病防控
《福建畜牧兽医 》 2020
摘要：肉鸽寄生虫病种类繁多,影响比较大的主要有鸽毛滴虫病、鸽球虫病、鸽蛔虫病、鸽体外寄生虫病等.本文就这几种主要寄生虫病的病原、临床症状与病变、诊断及防控进行阐述,以期对养鸽户养好肉鸽有所帮助.
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柚芽变株系类胡萝卜素代谢差异基因的转录组学分析
《热带作物学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为了研究'琯溪蜜柚'果实红肉突变株系类胡萝卜素代谢和芽变的分子机制,本研究以'琯溪蜜柚'及其芽变一代品种'红肉蜜柚'和芽变二代品种'三红蜜柚'果实为材料,使用RNA-seq技术研究3个品种3个发育时期果肉类胡萝卜素的代谢.经生物信息学分析,共筛选出参与类胡萝卜素生物合成显著差异表达的10个基因,分别为八氢番茄红素合成酶基因(PSY)、六氢番茄红素脱氢酶基因(ZDS)、类胡萝卜素异构酶基因(CRTISO1、CRTISO2)、紫黄质脱环氧酶基因(NPQ1)、9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶基因(NCED3、NCED5)、脱落醛氧化酶基因(AAO3)、ABA 8'-羟化酶基因(CYP707A1)、类胡萝卜素裂解双加氧酶基因(CCD4).共表达分析揭示了7个家族转录因子的表达模式与类胡萝卜素合成基因高度相关,分别为MADS、bZIP、bHLH、MYB、AP2/ERF、NAC和WRKY.通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证了部分基因的表达模式,结果与RNA-seq结果高度一致.此外,经对'红肉蜜柚'果肉转色期的初生和次生代谢通路DEGs富集分析,发现类胡萝卜素的积累过程中,细胞壁、脂质、类黄酮代谢差异基因大量富集.研究结果揭示,'琯溪蜜柚'果实红肉突变品种'红肉蜜柚'和'三红蜜柚'果实类胡萝卜素的形成和积累,是由类胡萝卜素的代谢相关酶基因差异表达和转录因子调控引起的;在果肉红色芽变的同时,伴随着与汁胞粒化相关的基因突变.这对进一步开展柚子果实类胡萝卜素的形成与积累、汁胞粒化研究,为解析柚果实不同颜色突变、汁胞粒化的机制有重要参考价值.
关键词： 琯溪蜜柚 芽变 类胡萝卜素 转录组 基因 转录因子
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