科研产出
黄皮转录组密码子使用偏好性分析
《分子植物育种 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：为全面了解黄皮(Clausena lansium)表达基因的密码子使用特点,以转录组测序获得的12 696条编码蛋白基因序列为数据来源,利用CodonW 14.4软件对其密码子碱基组成以及有效密码子数(effective number of codon, ENC)、同义密码子相对使用频率(relative frequency of synonymous codon, RFSC)等密码子使用参数进行计算和统计,发现黄皮表达基因密码子的平均GC含量为0.448,同义密码子第3位核苷酸的平均GC含量(GC3S)为0.400。表达基因整体的ENC取值为56.5,其中绝大部分的ENC值大于35,说明黄皮表达基因密码子使用偏好性程度整体水平较低。通过高频密码子分析法确定了GCU、AGA、AAU、GAU、AUU、UUU、UCU、CAU、CUU、UUG和GUU 11个高频密码子。将黄皮的密码子使用频率与人、小鼠、果蝇、酵母、大肠杆菌5种模式生物以及拟南芥、水稻、葡萄、草莓4种不同类型植物进行比较,发现其与果蝇和大肠杆菌存在较大差异,而与拟南芥和葡萄基本一致。以上研究结果对黄皮基因合适表达系统的选择以及外源基因在黄皮中的高效表达具有重要指导意义。
关键词： 黄皮 转录组 密码子用法 高频密码子 密码子偏好性
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柱前衍生-反相高效液相色谱测定茶叶中19种氨基酸含量
《食品科技 》 2018 北大核心
摘要：氨基酸是构成茶叶滋味的重要组成部分,茶汤的品质与其含量和成分的比例有关,为了更好地研究茶汤的品质,实验建立了一种快速检测茶叶中游离氨基酸的氯甲酸-9芴基甲酯(FMOCCl)柱前衍生-反相高效液相色谱(RP-HPLC)分析方法。该方法的色谱条件为:Phenomenex Kinetex C18反相色谱柱(100 mm×2.1 mm,2.6μm);流动相包含2部分,A相为含0.05 mol/L乙酸钠的水溶液(pH5.28),B相100%乙腈,梯度洗脱;流速0.15 mL/min;柱温(35±1)℃;紫外检测波长262nm,进样体积10μL时,在(0.004～1)mg/mL浓度范围内,19种氨基酸质量浓度与峰面积呈良好的线性关系,线性相关系数0.988～0.999,检出限(LOD,S/N≥3)范围(0.4～300)μg/mL,定量限(LOQ,S/N≥10)范围(0.8～500)μg/mL,且平均回收率90.29%～105.38%,相对标准偏差(RSD)范围0.36%～15.38%。应用此方法比较分析了不同香型凤凰单丛茶中19种游离氨基酸含量。
关键词： 茶叶 FMOC-Cl柱前衍生 反相高效液相色谱法 游离氨基酸
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木薯及其副产品的营养价值及在动物生产中的应用
《中国畜牧兽医 》 2018 北大核心
摘要：木薯耐干旱、耐贫瘠且易管理,其茎叶、块根及工业副产物营养物质含量较高,是一种优质的非常规饲料。木薯叶粗蛋白质、粗脂肪、灰分含量较高,含有丰富的钙、铁、锌、锰。木薯块根是很好的能量来源,其粗蛋白质、粗脂肪、矿物质、维生素含量低于木薯叶。木薯渣主要由木薯的外皮、破碎细胞壁等组成,粗蛋白质含量很低,粗纤维、中性洗涤纤维、酸性洗涤纤维含量较高,矿物质、氨基酸丰富,但钙、磷、氨基酸不平衡。木薯品种、生长条件、收割方式、收获时间、加工工艺等均会影响木薯及其副产品营养物质的含量。木薯中含有氰化物、单宁及植酸等抗营养因子,其中氰化物是限制木薯应用的最主要因素,其可结合细胞色素C氧化酶,阻断线粒体电子传递链,抑制有氧呼吸,导致中枢神经系统抑制和死亡。单宁、植酸与蛋白质结合生成络合物,阻碍营养物质的消化吸收,可通过水煮、烘烤、干燥等物理化学方法,以及发酵、育种等手段对木薯进行脱毒。研究表明,木薯及其副产品可广泛应用于动物生产中,对动物生长性能、肉品质无不良影响。开发与利用非常规饲料有利于缓解饲料资源紧张,降低养殖成本。作者详细介绍了木薯及其副产品的营养价值、抗营养因子及其脱毒方法以及其在动物生产上的应用,以期为木薯在畜禽养殖中的综合利用提供一定的参考。
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基于SFA模型的广东省农业现代化示范区技术经济效率测评及改进策略
《南方农业学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：【目的】在考虑经济社会影响的基础上,综合测算广东省22个大型农业现代化示范区的技术经济效率,为提升广东农业现代化示范区运行效率提出政策建议。【方法】针对各示范区所在区域经济社会环境差异较大的特点,构建SFA模型,对产出变量进行影响因素剔除,对广东省22个大型农业现代化示范区技术经济效率进行实证测算研究。【结果】广东省内经济发达地区有40%的农业现代化示范区技术经济效率比原来有所下降,且下降幅度较大,个别城市下降在0.5左右。经济次发达和欠发达地区技术经济效率有所上升,其中,次发达地区主要是纯技术效率上升导致综合技术经济效率上升,经济欠发达地区则是(纯)技术效率和规模效率共同上升导致综合技术经济效率上升。【建议】广东农业现代化示范区技术经济效率差异明显,经济社会因素对示范区效率有较大影响,今后需创新经营机制,加强财政资金投入,调整各要素投入,加强示范区管理并构建分类评估体系。
关键词： 技术效率 参数前沿生产函数(SFA)模型 农业现代化示范区 广东省
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仔猪胃肠道内分泌细胞分布与化学感应作用
《动物营养学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：胃肠道内分泌细胞(EECs)是胃肠道黏膜特化的上皮细胞,其数量超过机体其他部位所有内分泌细胞的总和,构成了机体最大的内分泌器官。研究发现,哺乳动物胃肠道至少有20多种EECs,其所分泌的胃肠激素在调节胃肠生理功能、能量平衡和摄食行为、胃肠化学感应、营养物质代谢以及免疫调节等方面发挥重要作用。本文综述了EECs的分类、EECs的研究手段和方法、仔猪EECs分布的研究进展,并总结了EECs的化学感应作用、EECs与免疫功能,以及肠道微生物与胃肠化学感应等方面的进展,从而为实施改善仔猪肠道健康和生长发育的营养调控措施提供科学依据。
关键词： 胃肠道内分泌细胞 胃肠激素 化学感应 仔猪 肠道微生物 免疫
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一株DMP降解菌的分离鉴定及特性研究
《农业环境科学学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：为分离邻苯二甲酸二甲酯(DMP)降解菌,本研究以长期覆盖塑料废弃物垃圾场的土壤为试材,采用选择性培养基筛选降解DMP的菌株,并研究其降解和生长特性。结果表明,分离获得了一株能降解DMP的菌株QD15-1,根据其菌落的形态特征、生理生化试验及16S rDNA碱基序列同源性分析,鉴定QD15-1为Paracoccus sp.,革兰氏阴性。底物利用试验表明,菌株QD15-1具有降解多种邻苯二甲酸酯(PAEs)的能力;以DMP为唯一碳源,菌株QD15-1生长的最佳条件为pH 8,温度30℃;动力学试验表明,降解DMP过程符合一级动力学方程,随着DMP初始浓度的增加,半衰期缩短;该菌株中含有降解PAEs的基因——邻苯二甲酸双加氧酶基因(PApht Ab)和3,4-二羟基-3,4-二氢邻苯二甲酸脱氢酶基因(PApht B)。液相质谱试验表明,降解的中间产物有邻苯二甲酸单酯、邻苯二甲酸,推测其降解DMP的途径为:将DMP降解成邻苯二甲酸单酯,再分解成邻苯二甲酸(PA),通过PApht Ab和PApht B的作用进一步降解。综上所述,QD15-1是一株高效降解DMP的菌株,在修复DMP污染方面有一定的应用前景。
关键词： 邻苯二甲酸二甲酯 16S rDNA 降解动力学 降解基因 中间代谢物
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广东省Ⅰ型鸭疫里氏杆菌分离鉴定及PFGE分型研究
《畜牧兽医学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：本文旨在研究广东地区Ⅰ型鸭疫里氏杆菌流行分布情况及其分子分型特点。2007—2017年,收集广东地区病死鸭、鹅的脑或肝组织等样品,进行菌株的分离、纯化及PCR鉴定等试验;采用玻片凝集的方法对鸭疫里氏杆菌进行Ⅰ型血清型鉴定,并进一步对血清Ⅰ型菌株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型,用BioNumerics 6.0软件进行聚类分析,比较同源性。结果表明:2007—2017年本实验室共分离保存220株鸭疫里氏杆菌,其中有119株为Ⅰ型血清型,占总分离株的54.09%。PFGE分型得到33种不同的PFGE分型图谱(以相似度≥85%为判断标准),可分为19个簇及14个单一型。血清Ⅰ型是广东地区鸭疫里氏杆菌的优势血清型。Ⅰ型鸭疫里氏杆菌分子型别呈现多样化,菌株之间的同源性差异较高,但存在小范围的克隆传播。
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Mi基因过表达载体和16D10基因RNAi载体的构建及转化
《华南师范大学学报(自然科学版) 》 2018 北大核心
摘要：文中采用PCR技术从番茄中克隆获得了Mi基因,采用反转录PCR(RT-PCR)技术从来源于红橘(Citus reticulate)的根结线虫中克隆获得了16D10基因,采用DNA重组技术构建了Mi基因的过表达载体和16D10基因的RNAi载体,分别命名为pB-Mi和pB-16DR.通过根瘤农杆菌介导的遗传转化,获得了经PCR检测为阳性的沙田柚转基因植株.这一结果将为研究Mi基因过表达和16D10基因的RNA干扰对柑橘根结线虫病的抗性影响提供试材和技术支持.
关键词： Mi基因 16D10基因 过表达载体 RNAi载体 根结线虫
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贮藏时间对单丛茶成分及其抑制脂肪酶、α-葡萄糖苷酶活性的影响
《华南理工大学学报(自然科学版) 》 2018 EI 北大核心 CSCD
摘要：以同一品种、不同贮藏时间(1996年、2006年、2016年)的单丛茶为研究对象,在分析、对比其成分的基础上,对其体外抑制脂肪酶和α-葡萄糖苷酶的生物活性进行研究,为单丛茶的深度开发和高值化利用提供一定的参考.结果表明:1996年和2006年单丛茶的茶多酚、儿茶素和游离氨基酸含量均低于2016年茶样,水浸出物、可溶性总糖、没食子酸和茶黄素含量均高于2016年茶样;1996年单丛茶提取物对脂肪酶活性的抑制率最高,为43.01%;2016年单丛茶提取物对α-葡萄糖苷酶活性的抑制率最高,为94.48%.不同贮藏时间下的单丛茶成分含量存在明显差异,这可能是导致其品质、功效等发生变化的重要原因.
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