科研产出
高羊茅FeTOC1基因的克隆、差异表达及亚细胞定位分析
《核农学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：拟南芥TOC1基因是中央振荡器的重要组成部分,其编码的蛋白质TOC1通过光周期途径调控拟南芥对光照的响应。为了揭示高羊茅FeTOC1基因的生物学功能,本研究通过同源克隆获得该基因全长cDNA序列,对其在不同光照水平下的表达模式进行分析,并对其编码的蛋白质进行亚细胞定位。结果显示,高羊茅FeTOC1基因的全长cDNA序列为1 557 bp,编码517个氨基酸;其编码的蛋白质N端存在大约120个氨基酸组成的非典型PR结构域,C端则存在大约50个氨基酸构成的CCT结构域;系统进化树分析显示高羊茅FeTOC1蛋白质与禾本科大麦、小麦及粗山羊草亲缘关系高达99%。将构建的目的蛋白与GFP融合表达载体注射入烟草中,发现FeTOC1主要定位在细胞核中。实时荧光定量分析发现,叶片中FeTOC1表达在长、短日照下表现出一定的昼夜节律性,表达峰值均出现在光照0～4 h;相比于持续黑暗,持续光照显著地削弱了FeTOC1表达的振荡节律;颠倒昼夜节律,FeTOC1基因的表达首先受外界昼夜交替信号的调节。综上所述,FeTOC1基因在高羊茅生物钟调节中发挥着重要作用。本研究结果为进一步探索FeTOC1基因的功能,进而培育适应短日照地区牧草新品种提供了一定的理论基础。
全文链接
请求原文
环嗪酮和敌草隆在甘蔗和土壤中的残留及消解动态
《农药 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]为探明敌草隆和环嗪酮在甘蔗上使用后的残留特性和安全性,建立了 QuEChERS-超高效液相色谱-串联质谱法测定甘蔗、甘蔗植株及土壤中敌草隆与环嗪酮残留的分析方法.[方法]样品经1%乙酸-乙腈(V∶V)提取,甘蔗以PSA净化,甘蔗植株以PSA+GCB净化,土壤以C18净化,UHPLC-MS/MS检测,外标法定量.在贵州和海南进行了敌草隆和环嗪酮在甘蔗和甘蔗田土壤的田间消解动态及最终残留试验.[结果]0.0005~2.0 mg/L范围内,敌草隆和环嗪酮在3种基质中质量浓度与对应的峰面积间线性关系良好(R2>0.99);在0.001、0.5、2.0 mg/kg添加水平下,敌草隆的回收率为80%~115%,RSD为3.21%~13.17%;环嗪酮的回收率为68%~109%,RSD为0.68%~8.06%;2种农药的方法定量限LOQ和检出限LOD均为0.001 mg/kg.敌草隆和环嗪酮在甘蔗和土壤中的降解动力学模型比较发现曲棍球模型HS动力学拟合效果更好,HS模型预测下敌草隆甘蔗上半衰期(DT50)为5.65、0.94d,在土壤中为5.07、3.07 d;环嗪酮在甘蔗植株中半衰期为2.00、0.29 d,在土壤中为1.95、2.65 d.敌草隆在甘蔗上的最终残留为 全文链接
请求原文
辣椒4CL基因家族成员的鉴定与生物信息学分析
《分子植物育种 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：4-香豆酸:辅酶A连接酶(4-coumarate:CoA ligase,4CL)基因家族调控植物木质素代谢、参与类黄酮和其他次生代谢产物合成.为了解辣椒Ca4CL基因家族的分子特性及生物学功能.本研究基于辣椒的全基因组测序结果鉴定4CL基因家族,并进行生物信息学分析.结果共鉴定获得8条辣椒4CL基因,不均匀的分布于基于3、7、11和12号染色体,其中Ca4CL06和Ca4CL08未锚定;辣椒Ca4CL的外显子数目在5~6之间,基序分析结果保守;分析顺式作用元件发现,在辣椒Ca4CLs上游2 000 bp序列中存在多个响应元件,包括光、Me-JA、厌氧诱导、低温等响应元件.辣椒4CL基因家族表达分析发现Ca4CL01在根、茎、叶、果皮(开花期后25 d,绿果期,转色期,转色10 d)、胎座(转色期,转色5 d,转色10 d)中均无表达,其余Ca4CLs表达具有较强组织特异性,Ca4CL04在叶、根、果皮等时期高表达.本研究为进一步分析Ca4CLs基因在生长发育、胁迫等条件下的功能和相应的信号转导途径提供了理论依据.
关键词： 辣椒(Capsicum annuum) 4CL基因家族 生物信息学分析 木质素
全文链接
请求原文
31种中草药及其复方对维氏气单胞菌体外抑菌研究
《淡水渔业 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为筛选对昆明裂腹鱼源维氏气单胞菌(Aeromonas veronii)有抑菌作用的中草药及复方,本研究通过煎煮法制备31种常见中草药水提取物,以牛津杯法测定各味中草药对该菌的抑菌圈直径,采用二倍稀释法测定最小抑菌浓度(MIC)和最小杀菌浓度(MBC);选取体外抗菌活性较好的6种中草药,应用棋盘法进行15组二联药方的部分抑菌浓度指数(FIC)试验;按正交设计表配伍25组复方,同样进行药敏试验.结果显示,31种中草药中,五倍子、地榆、诃子、苏木、黄芩、黄连等6种中草药抑菌效果最好;15组联用药方均未发生拮抗作用,其中以五倍子+地榆、诃子+黄芩联用效果最好,FIC分别为0.31、0.50,表现为协同作用;综合复方中草药的抑菌作用,复方F16(五倍子:地榆:诃子:苏木:黄芩:黄连=4:4:2:5:3:1)的抑菌效果最佳,抑菌圈直径达23.2 mm,MIC与MBC分别为0.98 mg/mL、1.95 mg/mL,可作为昆明裂腹鱼源维氏气单胞菌抑菌药物的首选配伍组合.
关键词： 维氏气单胞菌(Aeromonas veronii) 中草药 复方设计 抑菌
全文链接
请求原文
不同品种白菜对Cd的吸收富集特征与安全限值研究
《西南农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]研究不同品种白菜对Cd的富集规律及栽培土壤中Cd的安全限量值,为筛选Cd低累积白菜品种提供参考.[方法]通过盆栽试验,研究6个白菜品种(中青麻叶,麻叶火锅菜,高抗100,抗病大麻叶,鸡窝趴地白,厚叶早熟5号)在Cd浓度分别为0(CK)、0.3、0.6、1.2、2.4、4.8mg/kg条件下,其生物量变化、可食部分Cd含量富集特征及不同品种白菜与土壤Cd含量的相关性.[结果]随着Cd浓度增加,白菜没有出现毒害现象;不同白菜可食部分Cd富集系数为中青麻叶(1.61)>抗病大麻叶(1.38)>厚叶早熟五号(1.30)>高抗100(1.02)>麻叶火锅菜(0.76)>鸡窝趴地白(0.64),富集系数小于1的品种有麻叶火锅菜、鸡窝趴地白;Logistic模型方程拟合表明白菜可食部分Cd含量和土壤Cd浓度间相关性显著,相关系数为中青麻叶(0.9981)>麻叶火锅菜(0.9979)>高抗100(0.9976)>抗病大麻叶(0.9968)>鸡窝趴地白(0.9949)>厚叶早熟5号(0.9949);不同白菜对应土壤Cd安全限量值为鸡窝趴地白(0.30 mg/kg)>高抗100(0.24 mg/kg)>麻叶火锅菜(0.17 mg/kg)>厚叶早熟5号(0.12 mg/kg)>抗病大麻叶(0.09 mg/kg)>中青麻叶(0.06 mg/kg).[结论]依据白菜对土壤中Cd的耐受性、富集能力及对应土壤安全限量值,麻叶火锅菜、鸡窝趴地白、高抗100为Cd的低累积品种.
关键词： 白菜;重金属;富集特征;安全限值
全文链接
请求原文
烟草米根霉致病力及不同渗透压和pH环境下的代谢表型特征分析
《烟草科技 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为明确温度、叶位和创伤对烟叶霉烂病病原菌米根霉致病力的影响，及不同渗透压和pH环境下病原菌的代谢表型特征，采用穿刺法接种烟草离体叶片，测定了米根霉在不同温度及不同叶位烟叶中的致病力，并在Biolog PM 9和PM 10代谢板中96种渗透压和96种pH环境下培养米根霉，分析了其代谢表型特征。结果表明，米根霉可致病的温度范围为20℃～38℃，温度高于45℃无致病力；烟叶叶柄和叶片均可被侵染，创伤有利于侵染；米根霉对不同叶位烟叶的致病力间存在差异，其中对下部成熟叶的致病力较强，上部幼嫩叶的致病力较弱；米根霉具有广泛渗透压和pH适应能力，能在1%～10%（质量分数）氯化钠、3%～6%（质量分数）氯化钾、2%～5%（质量分数）硫酸钠、5%～20%（体积分数）乙二醇、1%～2%（质量分数）甲酸钠、2%～3%（质量分数）尿素、1%～12%（质量分数）乳酸钠、20～200 mmol·L-1的磷酸钠（pH 7.0）、10～100 mmol·L-1的硫酸铵（pH 8.0）、10～100mmol·L-1的硝酸钠等渗透环境中正常生长，不能在3%～6%甲酸钠、4%～7%尿素、20～200 mmol·L-1苯甲酸钠（pH 5.2）的渗透环境中生长；其pH适应范围为3.5～10.0，最适pH约为7.0。米根霉具有较强的脱羧酶活性和较弱的脱胺酶活性。
全文链接
请求原文
芭蕉芋和美人蕉全基因组Survey分析
《分子植物育种 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：芭蕉芋是一种富含淀粉的具有较高经济价值的多用途作物,而美人蕉属于常见的草本园艺观赏植物,虽然两个物种用途广泛,但是它们的分子机制研究一直没有重要突破.为了加速两者分子育种的发展,本研究利用高通量测序技术对芭蕉芋和美人蕉进行Survey分析,通过生物信息学分析,完成了芭蕉芋和美人蕉全基因组特征评估,获得了基因组大小、杂合度以及GC含量等信息,基于两个基因组的特征比较分析结果完成了芭蕉芋基因组的初步组装.结果表明,通过对芭蕉芋和美人蕉进行高通量测序,分别得到139.30和68.10 Gb高质量的测序数据,总测序深度分别约为140 x和68 x,估算的基因组大小分别约为844.90和836.88 Mb;根据K-mer分析估算全基因组GC含量分别为39.14%和38.48%,杂合度分别为0.63%和1.50%.由此可知,芭蕉芋和美人蕉基因组均属于较为复杂的基因组.对芭蕉芋尝试初步组装后得到总长为555.60 Mb的基因组.本研究获得了芭蕉芋和美人蕉基因组大小和特征等信息,为芭蕉芋和美人蕉的分子育种研究提供了有价值的数据与思路,初步比较了芭蕉芋和美人蕉基因组特征的异同,为后续构建两者全基因组精细图谱以及比较图谱提供了理论基础.
关键词： 芭蕉芋;美人蕉;基因组Survey分析;基因组大小;杂合度
全文链接
请求原文
瓜表皮有刺毛和无刺毛佛手瓜转录因子SeTTG1的分离及表达分析
《上海农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：以表皮有刺毛和无刺毛的2种佛手瓜为研究材料,对其Se TTG1转录因子进行克隆和分析。结果显示:2种佛手瓜中Se TTG1转录因子的ORF框长度均为1 026 bp,可编码341个氨基酸。无刺毛和有刺毛佛手瓜的Se TTG1核苷酸序列5个位点存在差异,分别在421、466、594、683和780位点上。推导的氨基酸存在3个位点差异,分别在141、156和228位点上。2种佛手瓜Se TTG1转录因子均含4个WD40基序。进化上,佛手瓜Se TTG1与葫芦科植物TTG1蛋白同源性较高。有刺佛手瓜茎和瓜中Se TTG1表达分别显著（P<0.05,1.36倍）和极显著（P<0.01,35.64倍）高于无刺瓜,而根和叶中的表达水平在2种类型中无显著差异。
全文链接
请求原文
授粉后不同时期玉米籽粒含水量相关QTL定位
《种子 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：成熟期籽粒含水量是影响玉米机械化收获的关键因素之一.为了解玉米籽粒含水量形成的遗传基础,鉴定控制玉米籽粒含水量变异的关键遗传区段,本研究以籽粒含水量差异较大的两个亲本构建的150份双亲分离群体为材料,基于GBS测序和表型鉴定结果,利用完备区间作图法鉴定控制玉米籽粒脱水相关性状变异的QTL.结果共定位到21个控制授粉后不同时期玉米籽粒含水量的QTL,单个QTL可解释4.02%~16.10%的表型变异,QTL大小变幅为69.17~5814.12 kb.其中QTL qKC 44-2和qKC 51-6/qKC 58-6与前人研究结果一致.本研究将这两个QTL分别从2412.28 kb缩小至115.29 kb,以及由1675.60 kb缩小至41.68 kb.此外,本研究还检测出19个新的控制玉米籽粒含水量的QTL,分别位于除第四染色体以外的9条染色体上.这些研究结果可为深度解析授粉后不同时期玉米籽粒含水量变化提供更丰富的遗传依据,还能为下一步的玉米籽粒含水量相关候选基因的图位克隆提供靶标.
全文链接
请求原文
鼠伤寒沙门菌sRNA SdsR靶基因的预测及验证分析
《福建农业学报 》 2022 CSCD
摘要：【目的】筛选鼠伤寒沙门菌sRNA SdsR的靶基因，为明确s RNA与靶基因的互作以及沙门菌的致病机制奠定基础。【方法】利用TargetRNA2软件预测sRNA SdsR的靶标，基于前期的s RNA SdsR敲除后转录组测序结果，将预测到的基因注释到GO、KEGG以及eggNOG数据库中进行分析，通过RT-qPCR对预测到的杂交能量较高的部分靶基因进行验证。【结果】TargetRNA2软件预测到29个靶标，其中hemA、STM0951、mreC、STM1 252、dcoC的杂交能量较高，且能与sRNA SdsR有连续的碱基匹配，分别与鼠伤寒沙门菌血红素合成、氧化还原过程、草酰乙酸脱羧酶的合成、膜的组成部分、细胞质蛋白的合成有关。RT-qPCR结果显示，相对于野生菌株3409，敲除s RNA SdsR后hemA、 mreC的表达分别下调0.70和0.39倍；STM0951、 STM1 252、 dcoC的表达分别上调0.51、 0.35和1.86倍。【结论】hemA、 STM0951、mreC、STM1252、dcoC基因很可能受s RNA SdsR的直接调控且对某些靶基因的表达有促进作用。
关键词： 鼠伤寒沙门菌 sRNA SdsR TargetRNA2 靶基因 转录组测序
全文链接
请求原文
