科研产出
利用环形染色体构象捕获技术对Bcl11b基因座位在细胞核内空间组织的研究
《中国细胞生物学学报 》 2013 CSCD
摘要：环形染色体构象捕获(4C)技术实现了在全基因组范围内捕获与4C靶位点发生相互作用的基因座位,因而通过4C相关技术可以进一步研究靶基因座位在细胞核内的空间组织形式。该文以Bcl11b基因座位作为4C分析的靶位点,通过优化4C分析的反向巢式PCR扩增条件,实现4C分析PCR的高效扩增;并通过有限克隆筛选与普通测序分析相结合的方法,在全基因组范围内捕获到一些与Bcl11b基因座位发生潜在相互作用的基因座位。这些基因座位与靶位点间的相互作用既有发生在相同染色体内的,也有发生在不同染色体之间的。这些基因座位间的相互作用表明了Bcl11b基因座位在细胞核内复杂的空间组织形式。
关键词： 环形染色体构象捕获技术 染色体构象捕获技术 Bcl11b基因座位 染色质空间组织
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雷蒙德氏棉3条染色体特异BAC的筛选与定位
《棉花学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：通过筛选海岛棉BAC文库并结合BAC-FISH技术成功获得雷蒙德氏棉D501、D502和D510染色体的特异BAC克隆,可作为这3条染色体的细胞学标记。这3个克隆在雷蒙德氏棉和海岛棉中进行比较作图,结果表明,它们在海岛棉中均表现出了染色体特异性,说明这3个BAC也可用于海岛棉Db01、Db02和Db10染色体的识别。其中BAC克隆280G06在两棉种10号染色体上的位置为非线性关系,可能在棉属的进化过程中发生了染色体结构的变异。
柱花草磷转运蛋白SgPT1的克隆和表达分析
《草业学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：磷是植物生长所必需的大量元素。高亲和磷转运子是控制植物对磷吸收和转运的主要蛋白。本研究以磷高效的柱花草基因型TPRC2001-1为对象,首先建立低磷胁迫下TPRC2001-1根系全长cDNA文库。通过同源克隆的方法,首次克隆到编码柱花草高亲和磷转运蛋白的基因,SgPT1。该基因全长cDNA为1 994bp,编码538个氨基酸残基,蛋白分子量为59kD。SgPT1蛋白具有高亲和磷转运子的结构特点,即含有"6+6"跨膜结构。而且,定量PCR分析结果表明低磷胁迫显著促进SgPT1在根部的表达,表明该基因可能参与低磷胁迫下磷的吸收和转运的过程。总之,以上结果表明SgPT1的加强表达可能是TPRC2001-1适应低磷胁迫的分子机制之一,为进一步研究柱花草适应低磷的分子机制提供候选基因。
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HCHs降解菌Sphingomonas sp.BHC-A在海南土壤中的应用效果评价
《热带作物学报 》 2013 CSCD
摘要：利用HCHs高效矿化菌Sphingomonas sp.BHC-A,对海南省澄迈县蔬菜种植区土壤微量残留的六六六(HCHs)进行微生物降解应用基础研究,评价BHC-A对HCHs的降解效果及其对土壤酶(脲酶、过氧化氢酶和纤维素酶)与土壤微生物群落的影响。结果表明:(1)BHC-A对该试验区土壤中残留的α-HCH和γ-HCH均具有降解作用,其中对γ-HCH的降解效果最为明显,27 d降解率达100%。(2)BHC-A对土壤脲酶、过氧化氢酶和纤维素酶活性存在显著促进作用,27 d时3种酶活性均高于对照土壤。(3)BHC-A对土壤细菌在短期(15 d)内存在促进作用,对放线菌在短期(15 d)内存在抑制作用,15 d后两者数量均恢复到对照水平;BHC-A对土壤真菌的影响较小,27 d内处理与对照无明显差异。说明降解菌BHC-A能够快速清除土壤残留HCHs,且不干扰试验区土壤可培养微生物群落结构。
关键词： 海南土壤 Sphingomonas sp.BHC-A 六六六 土壤酶 土壤微生物 微生物修复
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海南番木瓜PRSV和PLDMV病毒发生情况及分子鉴定
《热带作物学报 》 2013 CSCD
摘要：对海南昌江、乐东、澄迈、文昌和三亚5个主要番木瓜产区的病毒病发生情况进行调查。对76份番木瓜疑似病毒样品进行检测,检测结果表明海南番木瓜病毒病主要有2种:由番木瓜环斑病毒(Papaya ring spot virus,PRSV)引起的番木瓜环斑病毒病和由番木瓜畸形花叶病毒(Papaya leaf-distortion mosaic virus,PLDMV)引起的番木瓜畸形花叶病毒病。其中,番木瓜环斑病毒病最为常见,检出率达77.63%,是影响海南地区番木瓜产业健康发展的主要病毒病;畸形花叶病毒病发生率很低,仅检出2例番木瓜畸形花叶病毒病样品。以PRSV病毒基因组P1和Hc-Pro作为靶标基因进行分子克隆、测序,结果表明海南地区PRSV病毒可明显分为2个株系:HNPRSV-1株系和HN-PRSV-2株系。此外,基于CP基因的系统进化树分析结果表明在海南新发现的PLDMV病毒可能源于台湾和日本。本研究可为开展番木瓜花叶病的防控和创制抗花叶病毒番木瓜新种质提供数据参考。
关键词： 番木瓜 PRSV PLDMV 分子鉴定 系统进化树
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橡胶树果糖-1,6-双磷酸酯酶基因的克隆及表达特性分析
《植物生理学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：果糖-1,6-双磷酸酯酶(FBPase)是糖异生途径中的关键酶,在糖代谢中起重要作用。本研究首次从橡胶树中克隆并获得胞质型HbFBPase基因,其全长cDNA序列1541 bp,包含一个1017 bp的开放阅读框,编码一个由338个氨基酸残基组成的蛋白质。氨基酸同源性分析发现,该蛋白含有保守的FBPase活性位点、腺嘌呤核糖核苷酸(AMP)结合位点及金属离子结合位点。生物信息学分析显示,HbFBPase蛋白无导肽酶切位点,不具有跨膜结构域,且为亲水蛋白,推测该蛋白可能在细胞质中发挥作用。实时荧光定量PCR分析表明,HbFBPase基因在叶中高表达,胶乳及种子次之。进一步分析HbFBPase基因在非光合库组织胶乳(产胶细胞的细胞质)中的表达模式,结果显示该基因表达受割胶、伤害处理调控,推测其在橡胶树胶乳糖代谢中发挥重要的调控作用,参与了橡胶烃的生物合成调控。此外,HbFBPase基因表达受多种植物激素如乙烯(ET)、脱落酸(ABA)、茉莉酸(JA)、植物生长素(2,4-D)、水杨酸(SA)及赤霉素(GA)的调控。本研究初步揭示HbFBPase是橡胶树胶乳糖异生作用的关键酶,是胶乳糖酵解及橡胶合成的负调控因子,为探讨胶乳糖异生与橡胶烃合成之间的关系提供理论基础,有助于进一步了解胶乳糖代谢的调控机理。
关键词： 橡胶树 HbFBPase 基因克隆 生物信息学分析 基因表达
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椰子不同部位LPS、PPO以及POD活性分布的研究
《广东农业科学 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：针对椰子加工业存在贮运难、易变质、手工操作复杂等难题,研究椰子中不同部位的酶活性分布,力求明确贮运过程中椰子内部的生理变化。结果表明,椰子中不同部位的脂肪酶(LPS)、多酚氧化酶(PPO)和过氧化物酶(POD)活性存在显著性差异,但活性分布趋势一致,其中种皮的3种酶活性均为最高,带皮椰肉和白椰肉分别次之;贮藏过程中,除了白椰肉中PPO的变化不显著外,各部位酶活性均呈大幅度的增长趋势,其中种皮中的酶活性增幅最大。可见LPS、PPO和POD 3种酶活性的变化均是制约椰子货架期以及种皮开发利用的主要因素。加热、微波等前处理均是抑制椰子体内酶活,改善种皮加工品质的有效方法。
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运用SmartRoot测量橡胶树细根
《植物生态学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：SmartRoot是基于开放源ImageJ的免费根系分析软件,通过软件分析根系照片可得到细根长度、表面积、体积和平均根直径等指标。该文以橡胶树(Hevea brasiliensis)细根为例,探索利用SmartRoot分析细根不同形态特征的可能性。用不同拍照距离与分析方式的对比确定橡胶树细根适合的研究方法,用WinRhizo软件分析结果验证结果的准确性。结果表明,不同拍摄高度下对应的细根长度、表面积、体积和平均根直径等指标的标准均方根误差(NRMSE)分别为2.87%、15.73%、32.38%和16.88%;手动分析与半自动分析相同照片细根长度、表面积、体积和平均根直径等指标的NRMSE分别为3.06%、21.00%、40.96%和11.64%;用WinRhizo软件验证SmartRoot分析细根长度、表面积、体积和平均根直径等指标结果NRMSE分别为5.31%、9.37%、9.61%和5.77%。本研究表明,在适当方法下,拍照法结合SmartRoot软件分析测量橡胶树细根细根长度、表面积、体积和平均根直径等指标有较高的准确度,可用于橡胶树细根指标的分析。
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椰肉氨基酸测定与营养评价
《热带作物学报 》 2013 CSCD
摘要：为了研究椰肉氨基酸组成及含量,以海南省文昌市的7个椰子品种为材料,采用液相色谱技术法对不同品种椰肉氨基酸进行测定,同时根据氨基酸的组成及含量,运用聚类分析方法对7个椰子品种进行分类。结果表明:椰肉中17种氨基酸总质量分数在3.58%～5.80%之间,平均为4.29%。其中以文椰2号品种总氨基酸质量分数最高,文椰4号最低;必需氨基酸的含量在文椰2号和文椰3号中最高,而在小黄椰子中最低;鲜味氨基酸含量在文椰2号和文椰3号中最高;椰肉总氨基酸含量愈高,则必需氨基酸和鲜味氨基酸含量亦愈高;7个椰子品种可分为3大类群;氨基酸综合评价以文椰2号和文椰3号最佳。
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采前施用钾肥对菠萝果实贮藏特性的影响
《热带作物学报 》 2013 CSCD
摘要：为提高果实的贮藏品质,以菠萝品种巴厘(Ananas comosus cv.Comtede Paris)为试材,采用滴灌形式,研究施钾(硫酸钾和氯化钾)对果实贮藏期间可溶性固形物、可溶性蛋白、维生素C、可滴定酸和可溶性糖的影响。结果表明:适量增施硫酸钾能提高果实采收时可溶性糖、可溶性蛋白、可滴定酸、维生素C的含量;延缓果实贮藏中后期可溶性固形物、维生素C和可滴定酸含量的下降,提高可溶性蛋白含量。而增施氯化钾则显著减少了采收时果实可溶性固形物含量,并且不影响贮藏期间果实维生素C含量。因此,施900 kg/hm2硫酸钾处理果实贮藏品质更好。
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