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基于基因分型技术的燕麦SNP标记研究

华北农学报 2019 北大核心 CSCD

摘要:为加快燕麦分子辅助育种进程,以1981-1983年进行抗旱性鉴定的42份燕麦种质(18份低抗、13份中抗、11份高抗)和12个未鉴定的燕麦育成品种为试验材料,采用PstⅠ/MspⅠ双酶切的dd-GBS基因分型技术构建燕麦简化基因组参考序列,通过Stacks、主成分分析、Fisher Test和Blast分析研究燕麦SNP分子标记。测序结果表明,燕麦个体的高质量reads数在4 111 218~19 019 296,利用Stacks软件成功组装753 325条燕麦简化基因组参考序列,共注释74 657个群体SNP位点。主成分分析表明,燕麦SNP基因型大致聚为2簇,其中一簇主要由14份低抗种质组成,另一簇则包含全部11份高抗种质。进一步的Fisher Test差异显著性统计分析表明,相对于燕麦低抗种质材料,共有2 937个SNP标记在燕麦高抗种质材料中差异显著((错误发现率False Discovery Rate,FDR)<0. 05),其中,55个SNP标记差异极显著(FDR <0. 001)。将上述55个SNP标记所在源序列与小麦基因组序列在Phytozome数据库中进行比对(Blast)发现,14个SNP位点可能参与燕麦抗旱生物学信号通路基因的表达,其中包括参与植物激素信号转导来调控燕麦的抗逆性。通过GBS技术成功组装的燕麦简化基因组参考序列,丰富了当前燕麦的基因组数据库。通过统计学分析得到的55个SNP标记与小麦基因组数据库进行比对,结果发现,14个SNP标记将对燕麦分子辅助育种和加速育种进程具有重要的指导意义,更可为今后的燕麦种质资源大规模快速筛选奠定技术基础。

关键词: 燕麦 基因分型技术 抗旱 基因型 SNP

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无硫复合护色剂对冷藏桃抗氧化酶活力的影响

食品工业 2019 北大核心

摘要:为探讨无硫复合护色剂减轻冷害的效果,以"水蜜桃"为试材,试验共设3组:非处理桃(阴性对照)、无硫复合护色剂处理桃和1-MCP处理桃(阳性对照),经40 d冷藏后,测定桃果肉中VC、多酚和抗氧化酶的水平和活力.结果表明,与非处理对照组相比,无硫复合护色剂处理下冷藏桃果实的VC含量、多酚水平和抗氧化酶活力,包括超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化氢酶(CAT)、抗坏血酸过氧化物酶(APX)、谷胱甘肽还原酶(GR)、多酚氧化酶(PPO),均维持较高水平;丙二醛水平和过氧化物酶(POD)活性均显著较低.从指标分析来看,无硫复合护色剂在维持抗氧化酶活力和抑止褐变的作用效果优于1-MCP.试验表明无硫复合护色剂处理可通过维持较高的抗氧化酶活力、降低氧化应激和多酚氧化,从而有利于减轻桃果实冷害的发生和果肉的褐变.

关键词: 冷害 褐变 无硫复合护色剂 抗氧化酶 多酚

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间作豆类作物对大樱桃生长和土壤特性、微生物数量的影响

北方园艺 2019 北大核心

摘要:以‘红玛瑙’大樱桃为试材,采用随机区组排列设计方法,以清耕为对照,在果园建植第2年研究了果园间作绿豆、豇豆、豆角、红小豆、黑小豆和大豆后大樱桃树生长指标、果园土壤理化性质和微生物区系的变化,分析了不同间作模式对大樱桃幼树生长和土壤环境的影响,以期为果园作物间作模式的应用提供参考。结果表明:幼龄果园间作豆类作物后,大樱桃地径极显著低于清耕对照,间作绿豆、红小豆、大豆对大樱桃幼树株高无显著影响,而间作豆角、豇豆、黑小豆处理中大樱桃株高生长受到显著抑制。间作不同豆类作物后土壤全磷、硝态氮、有效锰、有效锌含量和pH呈上升趋势,电导率(EC)与对照持平,全钾、铵态氮、速效钾、全硒含量和阳离子交换量(CEC)呈下降趋势,土壤含水量也显著减少,全氮、有效磷和有机质含量变化则因作物不同而异。土壤真菌数量在所有间作处理中均显著提高;土壤放线菌数量除在绿豆处理中与对照无显著差异外,在其余处理中均极显著升高;土壤细菌数量在绿豆处理中与对照无显著差异,在豇豆处理中极显著减少,在其余处理中极显著提高。

关键词: 大樱桃 间作 豆类 土壤养分 土壤微生物

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利用微卫星标记分析山西糜子的遗传多样性

植物遗传资源学报 2019 北大核心 CSCD

摘要:山西是中国糜子主产区之一,有丰富的地方品种和农家种种质资源。利用微卫星标记分析糜子资源的遗传多样性,明确其遗传背景,便于加强糜子各品种之间的基因交流以及优异种质的筛选和利用,同时对种质资源的亲缘关系分析提供科学依据。利用27对SSR引物分析57份山西糜子的遗传差异,采用PowerMarker 3.25计算每对引物的多态性信息含量,采用PopGen1.32计算每对引物和两个生态区的观测等位基因等遗传参数。用MEGA5.0构建Neighbour-Joining聚类图,利用Structure 2.3.4鉴定遗传类群,采用Ntsys2.11进行主成分分析。结果显示27对SSR引物共检测出71个等位变异,平均每个位点扩增出2.6296个等位基因,各引物对的有效等位变异占观测等位变异的76.94%。各引物对的基因多样性指数为0.4140~1.0446,平均为0.7686;PIC为0.0601~0.7158,平均为0.5667。两生态区的观测杂合度等遗传参数相差不大。基于N-J遗传距离将57份材料分为3个类群,类群Ⅰ属于黄土高原春夏糜子区,类群Ⅱ、类群Ⅲ均属均于北方春糜子区和黄土高原春夏糜子区。遗传结构分析将57份糜子材料分为3个类群,绿色类群的基因多样性指数和PIC比蓝色、红色类群高。两种聚类结果基本一致,分布方式均与地理位置相关。主成分分析结果将晋北部材料与晋中、晋南部材料相区别,说明两生态区糜子的遗传背景因地理气候因素有明显差异,与遗传结构群体分析结果一致。研究表明,山西省糜子资源的遗传多样性丰富。

关键词: 糜子 SSR标记 聚类分析 遗传结构 主成分分析

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黑曲霉改性沼渣对水中Pb(Ⅱ)的生物吸附

科学技术与工程 2019 北大核心

摘要:经黑曲霉改性的沼渣首次作为生物吸附剂,处理含Pb~(2+)模拟废水,并取得较高吸附量。经黑曲霉改性后,沼渣比表面积由1.524 7 m~2·g~(-1)提高到7.054 2 m~2·g~(-1);且沼渣表面长有大量气生菌丝体与孢子,表明黑曲霉改性过程具有提高沼渣吸附潜力的作用。研究选取不同p H和投加量作为影响因素探求其对生物吸附量的影响。实验结果表明,最适合p H为4~自然p H,在投加量为0.1 g、温度为30℃、自然p H条件下,沼渣和改性沼渣对于Pb~(2+)的最大吸附量分别为2.86 mg·g~(-1)、6.32 mg·g~(-1);说明黑曲霉改性沼渣的吸附能力优于沼渣,主要是由于黑曲霉菌分泌的酶和产生的孢子与气生菌丝体提高了沼渣表面的吸附特性。改性沼渣的吸附动力学数据对二级动力学方程的拟合效果最好,说明改性沼渣的生物吸附更多涉及到化学吸附。因此,黑曲霉改性后的沼渣可能成为一种有前景的生物吸附剂。

关键词: 生物吸附量 沼渣 改性沼渣 黑曲霉

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青贮饲料中霉菌毒素的产生及对反刍动物健康的影响

中国饲料 2019 北大核心

摘要:青贮饲料营养丰富,适口性好,易消化且能够长期保存,是反刍动物日粮中最重要的组成部分之一。青贮饲料在收获、发酵以及取用过程中都有可能受到霉菌毒素的污染,其中主要包括黄曲霉毒素B1、玉米赤霉烯酮、脱氧雪腐镰刀菌烯醇、赭曲霉毒素A、伏马菌素以及其他真菌次级代谢产物。反刍动物摄取发霉青贮饲料,会对其生产性能及健康产生严重影响。加强青贮饲料收获前、青贮过程及饲喂期的管理,对于减少反刍动物饲料中的霉菌毒素污染至关重要。此外,某些霉菌抑制剂或微生物接种剂也可降低毒素的污染水平。本文主要就青贮饲料生产过程中出现的各种霉菌、霉菌毒素以及其对反刍动物健康的影响进行了综述,旨在为控制青贮饲料制作和饲喂过程中霉菌毒素的污染,降低经济损失提供参考。

关键词: 青贮饲料 霉菌 霉菌毒素 反刍动物 脱毒

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番茄抗TYLCV分子标记辅助聚合育种

中国瓜菜 2019 北大核心

摘要:为了培育对TYLCV(Tomato yellow leaf curl virus)抗性稳定持久、园艺性状优良的番茄品种,以分别含有Ty-1、Ty-2、Ty-3的3个抗源材料‘TY52’‘CLN2777A’‘R1164’为供体亲本,2个园艺性状优良的不含抗病基因的育种材料‘TMX255-1’‘TMX255-5’为受体亲本,通过杂交和多代回交自交,同时利用分子标记辅助选择技术、苗期接种技术和农艺性状观察对后代进行筛选,将Ty-1与Ty-2导入并聚合到‘TMX255-1’,Ty-1与Ty-3导入并聚合到‘TMX255-5’,最终获得2份聚合了不同抗病基因的株系,分别命名为‘TY1-2’‘TY1-3’,并对其进行了抗性评价,结果显示,2份株系对TYLCV整个生育期在田间都表现抗病,且园艺性状优良稳定,可以作为自交系应用于抗病育种中。

关键词: 番茄 TYLCV 分子标记 聚合育种

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控制高粱分蘖与主茎株高一致性的基因定位

作物学报 2019 北大核心 CSCD

摘要:用分蘖与主茎株高一致的高粱品系K35-Y5与分蘖明显高于主茎的高粱恢复系1383杂交,F1自交获得F2分离群体,构建两混池,采用BSA(bulked segregation analysis)和SLAF(specific length amplified fragment sequencing)技术将高粱分蘖与主茎株高一致基因定位.遗传分析表明,分蘖与主茎株高一致性状由1对隐性核基因控制.参考已公布高粱基因组设计酶切方案,构建SLAF文库并测序.对高粱参考基因组序列进行电子酶切预测,确定限制性内切酶为Rsa I+Hae III,酶切片段长度为364~414 bp;测序Q30为91.70%,GC含量为45.79%,达到测序要求;与水稻的测序数据相比,高粱的双端比对效率为93.35%,酶切效率为90.60%,SLAF建库正常.共获得30.80 M reads,开发出133,246个SLAF标签,再通过分析SLAF标签的多态性,检测到319,428个SNP位点.利用SNP-index法和Euclidean distance法及取两者交集进行关联分析,最后得到一个关联区域,位于第9染色体上的54,788,026~56,740,873区间内,关联区域长度1.95 Mb.分析关联区域内的基因在2个亲本之间SNP,对这些SNP进行变异的注释,发现4个非同义突变的SNP.经验证,这4个SNP位点和分蘖与主茎株高一致性状相关.对应到Sobic.009G197901.1、Sobic.009G213300.1和Sobic.009G221200.1三个基因上,这些基因可能是与性状直接相关的功能基因.

关键词: 高粱 分蘖与主茎株高一致 SLAF SNP

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苹果早熟新品种‘六月红’的选育

中国果树 2019 北大核心

摘要:‘六月红’是由‘Arkasas Black’בSummer Apple’杂交育成的苹果早熟新品种。平均单果重148g;果实近圆形,果面光洁,底色黄绿,着浓红色;果肉黄白色,酸甜适口,有淡香味,可溶性固形物含量12.5%,品质上等。在山西省晋中地区,果实6月下旬至7月上旬成熟,发育期75 d;具有易成花、早果、丰产等特点。

关键词: 苹果 早熟 新品种 ‘六月红’

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苹果黄蚜细胞色素P450基因AcCYP6CY14的表达及其在抵抗吡虫啉中的作用

应用昆虫学报 2019 北大核心 CSCD

摘要:【目的】研究苹果黄蚜Aphis citricola细胞色素P450基因AcCYP6CY14的表达及其在抵抗吡虫啉中的作用。【方法】搜索苹果黄蚜转录组数据库,获得细胞色素P450基因AcCYP6CY14的cDNA部分序列,采用RT-PCR技术克隆目的基因cDNA序列全长。利用实时定量PCR(Real-time quantitative PCR,RT-qPCR)技术测定目的基因在苹果黄蚜不同发育阶段的表达水平。采用浸虫法,用浓度为LC30的吡虫啉对苹果黄蚜3龄若蚜进行诱导,RT-qPCR检测吡虫啉诱导不同时间后P450基因的表达情况。利用RNA干扰(RNAi)技术沉默苹果黄蚜3龄若蚜的P450基因,并研究该基因沉默后,苹果黄蚜对吡虫啉的敏感性。【结果】获得苹果黄蚜细胞色素P450基因的cDNA全长序列,为1 542 bp,编码513个氨基酸,命名为AcCYP6CY14(GenBank登录号:MH717248)。研究发现该基因在苹果黄蚜各个发育阶段均有表达,在3龄若蚜中表达量最高。经吡虫啉诱导12 h后,该基因的相对表达量显著高于对照。dsRNA饲喂结果显示,苹果黄蚜取食ds AcCYP6CY14 24 h后,将其转接到新鲜的苹果嫩稍上,24、48、72 h后,该基因的表达量显著下调。沉默该P450基因后,苹果黄蚜对吡虫啉的敏感性极显著升高(P<0.01),死亡率提高了65.2%。【结论】克隆得到了苹果黄蚜P450基因AcCYP6CY14的cDNA全长序列,该基因在苹果黄蚜整个生育期均有表达,且在3龄若蚜中表达量最高,推测该基因可能参与了苹果黄蚜对吡虫啉的解毒代谢。

关键词: 苹果黄蚜 吡虫啉 细胞色素P450 RNA干扰 解毒代谢

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