科研产出
棉花类表皮特异性分泌糖蛋白基因GhA01EP1的克隆和功能分析
《棉花学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：【目的】本研究对类棉花表皮特异性分泌糖蛋白基因GhA01EP1的克隆及功能分析,为进一步了解胞外蛋白抵抗环境胁迫的调控机制提供了基础。【方法】利用同源克隆法获得了冀2658中Gh A01EP1的序列,通过实时定量聚合酶链式反应检测GhA01EP1基因的组织表达及干旱胁迫前后表达变化。对GhA01EP1蛋白的理化性质、结构、亚细胞定位等进行了生物信息学分析。用烟草瞬时转化试验对GhA01EP1蛋白进行亚细胞定位。利用农杆菌蘸花法获得转基因拟南芥,并对转基因植株进行抗旱鉴定。【结果】将克隆到的与抗旱相关的类表皮特异性分泌糖蛋白基因命名为GhA01EP1,位于A01号染色体。该基因无内含子,开放阅读框长1 371 bp,编码456个氨基酸,包含B-lectin、Plant PAN/APPLE-like 2个结构域。Gh A01EP1基因在根、茎和叶片中均有表达,在根中表达量最高。KEGG通路分析发现,GhA01EP1参与甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢以及苯丙氨酸代谢的可信度较高。烟草瞬时转化试验结果显示,GhA01EP1蛋白为分泌蛋白。抗旱鉴定发现,与野生型相比,转基因拟南芥在干旱胁迫下长势好、根系长、胁迫复水后恢复能力强。【结论】GhA01EP1基因在棉花和拟南芥抗旱中起积极作用。
关键词： 陆地棉 GhA01EP1 分泌蛋白 非生物胁迫 功能验证
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河北省玉米小斑病菌玉米离蠕孢dsRNA病毒的检测及带毒菌株的生物学特征
《菌物学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：玉米小斑病是我国玉米生产上的重要病害之一,每年造成玉米大幅减产。真菌病毒能够在真菌体内进行复制和繁殖,可以作为生物防治的潜在资源。为了明确河北省玉米小斑病菌玉米离蠕孢ds RNA病毒的多样性及生物学特性,为玉米小斑病的防控提供潜在生防资源,本研究采用单孢分离的方法分离纯化玉米小斑病菌150株,通过ds RNA提取及凝胶检测的方法检测带毒率,从分离的150株玉米离蠕孢中获得10株带有ds RNA病毒的菌株。通过电镜观察及RT-PCR方法验证发现5个菌株带有Bipolaris maydis partitivirus病毒。通过原生质体脱毒的方法获得无毒菌株后比较带毒菌株的生物学特性及胞外酶的分泌。结果发现Bipolaris maydis partitivirus病毒降低了玉米离蠕孢的生长速度和产孢量,显著降低其致病力及淀粉酶的分泌。本研究明确了河北省玉米离蠕孢ds RNA病毒的多样性,明确了携带Bipolaris maydis partitivirus病毒菌株的生物学特性,为玉米小斑病的防控提供了研究基础。
关键词： 玉米小斑病 dsRNA病毒 离蠕孢partitivirus病毒 生物学特征 致病力
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太岁DNA提取方法差异及对测知细菌结构的影响
《扬州大学学报(农业与生命科学版) 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：以太岁取样的加水热溶解为特点设计4种提取方法,将提取效果好的2个DNA样品用Illumina MiSeq高通量测序平台测序。结果表明:滤膜法（SI3）和研磨法均可获得显示电泳条带的DNA,但前者能将太岁材料彻底破碎和滤除多糖;滤膜法样品测得优质序列46 676条,聚类OTU 1 095个,比研磨法多154个,只包含1个序列相对丰度大于1%的共有OTU,特有1个序列相对丰度41.14%的OTU,是研磨法的237倍,但滤膜法样品香农指数反比研磨法低1.37%,并导致两者菌群结构在各分类水平上有着明显差别。太岁DNA提取方法深刻影响细菌结构测定结果,滤膜法DNA菌群信息更真实,据其测知的优势结构为假单胞菌属（Pseudomonas）和不动杆菌属（Acinetobacter）。
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太岁中真菌菌群结构及分离菌株的DNA验证
《福建农林大学学报(自然科学版) 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为明确太岁中真菌菌群结构及分离真菌菌株存在的真实性,在太岁组织不同层次重复取样,采用热溶解膜过滤法处理后提取DNA,Illumina Miseq高通量测序,并进一步将从太岁中分离的腐皮镰刀菌（Fusarium solani）与测序结果中的同属OTU做相似性比对.结果表明:供试太岁所含真菌多样性丰富,包括12个门56个目146个属;真菌分布不均匀,内层多样性高于外层;相对丰度≥1%的内外层共有属分别是以土壤为生境的虫草属（Cordyceps）、曲霉科未分类属（unclassified Aspergillaceae）、踝节菌属（Talaromyces）,占比之和为11.13%～25.19%;分离的腐皮镰刀菌在测序数据中能比对到相似性为100%的OTU802.可见,太岁中真菌不存在共同优势菌群,对太岁形成作用有限,但能印证其生境为土层;太岁中腐皮镰刀菌及一些常见真菌真实存在.
关键词： 太岁 热溶解膜过滤法 真菌结构 腐皮镰刀菌 分离鉴定 DNA验证
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三种杀虫剂对烟粉虱优势寄生蜂海氏桨角蚜小蜂的安全性评价
《环境昆虫学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为评价噻虫嗪、阿维菌素和氟啶虫胺腈对烟粉虱优势寄生蜂海氏桨角蚜小蜂Eretmocerus hayati的安全性,采用琼脂保湿浸叶法分别测定了3种杀虫剂对烟粉虱成虫和海氏桨角蚜小蜂成蜂的室内毒力以及对海氏桨角蚜小蜂蛹羽化率的影响.结果表明,噻虫嗪、阿维菌素和氟啶虫胺腈对烟粉虱的LC50分别为453.76 mg/L、2.00 mg/L和29.47 mg/L,对海氏桨角蚜小蜂成蜂的LC50分别为0.23 mg/L、1.07 mg/L和0.64 mg/L.通过风险系数评估,表明阿维菌素对海氏桨角蚜小蜂成蜂安全,而噻虫嗪和氟啶虫胺腈对该蜂成蜂具有轻微到中度毒性.3种杀虫剂在烟粉虱和寄生蜂之间的选择性毒力指数表明噻虫嗪对海氏桨角蚜小蜂的负向选择性最强,其次是氟啶虫胺腈,阿维菌素最弱.3种杀虫剂均可显著降低海氏桨角蚜小蜂蛹的羽化率,对蛹的毒性为轻微有害,风险等级为2级.本研究结果将为烟粉虱综合治理中协调使用寄生蜂和化学药剂奠定理论基础.
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不同植物生长延缓剂和除草剂对苜蓿/玉米套作系统产量和种间竞争的影响
《草业科学 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为解决夏季在单作紫花苜蓿（Medicago sativa）田中套作青贮玉米（Zea mays）后苜蓿和苗期玉米种间竞争的问题,于2018–2019年在套播青贮玉米后对苜蓿喷施3种植物生长延缓剂（调环酸钙、多效唑和甲哌鎓）和两种玉米田除草剂（丁异莠去津和异丙甲草胺）,分析其对苜蓿和玉米种间竞争和系统生产力的影响。结果表明:植物生长延缓剂和除草剂混施没有交互作用;除2019年多效唑增加套作期间苜蓿的产量外,与清水对照（CK）相比,3种植物生长延缓剂对苜蓿的抑制作用不显著（P> 0.05）,未能改变苜蓿、玉米以及系统的总产量。与CK相比,除草剂丁异莠去津对苜蓿的抑制作用显著（P <0.05）,降低了苜蓿再生初期的株高、叶绿素含量和套作期间的产量,显著增加了套作玉米的产量（P <0.05）,但对苜蓿第2年春季的生长也造成了影响,导致2019年系统总产量和食物当量值显著降低（P <0.05）。异丙甲草胺处理玉米、苜蓿的产量与CK差异不显著（P> 0.05）,但对苜蓿春季产量有提高作用,系统总产量和食物当量值有升高的趋势。本研究采用的植物生长延缓剂和除草剂均未能达到在保证系统生产力的前提下短期有效抑制苜蓿再生、缓解苜蓿与套作玉米苗期的竞争的目的。
关键词： 紫花苜蓿 青贮玉米 套作 生长延缓剂 除草剂 种间竞争 生产力
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华北地区灌水量对设施甜瓜产量、品质及耗水特征影响
《北方园艺 》 2021 北大核心
摘要：以厚皮甜瓜“西州蜜25号”为试材,对4个灌水量（W1:7.5 mm;W2:15.0 mm;W3:22.5 mm;W4（CK）:30.0 mm）下,甜瓜各生育期060 cm土壤水分动态进行监测,结合作物产量分析甜瓜水分利用效率,同时对植株干物质量及甜瓜果实的品质进行测定,以期为探求灌水量对华北地区设施甜瓜产量、水分利用效率（WUE）、耗水特征及品质的影响。结果表明:灌水量与耗水量呈线性正相关,耗水量与产量呈二次曲线关系,耗水量与WUE呈线性负相关。W3产量最高,高于对照4.6%;随着灌水减少,水分利用效率显著增高,与CK相比增高56.81%84.81%。降低灌水量,甜瓜各个生育期耗水强度显著降低,同时增加对土壤贮水消耗;品质综合评价指标随灌水量增高先增高后降低,W2品质最高,显著高于对照。综合考虑产量、品质、水分利用效率条件下,华北地区设施厚皮甜瓜选择每次灌溉15.022.5 mm为宜。
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RNA-seq分析葡萄霜霉菌对枯草芽胞杆菌HMB-20428与嘧菌酯协同反应的影响
《植物病理学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为明确葡萄霜霉菌对枯草芽胞杆菌与嘧菌酯协同的反应,采用显微表型观察明确枯草芽胞杆菌与嘧菌酯协同对葡萄霜霉菌的抑制作用,RNA-seq分析葡萄霜霉菌基因对枯草芽胞杆菌与嘧菌酯的协同表达,并通过qRT-PCR验证显著差异表达基因,通过荧光强度和高效液相色谱测定对重要代谢成分活性氧和ATP酶的影响。结果显示,枯草芽胞杆菌与嘧菌酯协同对葡萄霜霉菌的抑制作用为98.87%,孢子囊明显干瘪,内含物大量释放,与细胞壁明显分离,明显优于单独处理;葡萄霜霉菌对枯草芽胞杆菌与嘧菌酯协同反应共有1 116个（上调305个,下调811个）基因发生差异表达,明显高于单独处理;通过GO、KEGG功能注释和功能富集分析,显著差异变化基因有140个;显著差异变化基因对枯草芽胞杆菌与嘧菌酯协同反应主要导致活性氧含量增加,ATP下调,同时阻碍ABC的转运,从而影响RNA的转录水平,破坏蛋白质、氨基酸等的代谢;qRT-PCR验证与RNA-seq数据具有很好的相关性;葡萄霜霉菌协同反应后活性氧含量增加以及胞内ATP含量大大降低,显著抑制能量的合成。
关键词： 葡萄霜霉菌 协同反应 RNA-seq 枯草芽胞杆菌 嘧菌酯
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核桃Alfin-like基因家族鉴定与转录表达分析
《河北农业大学学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为了揭示核桃Alfin-like家族在核桃响应低温胁迫中的作用,本研究通过生物信息学与RNA-seq结合的方法,在核桃全基因组数据库搜索Alfin-like家族基因,对该家族进行生物信息学和转录表达分析。结果表明,核桃Alfin-like基因家族包含8个成员,分布在5条染色体上,蛋白长度范围为240（JrAL5）～254（JrAL1）个氨基酸,开放阅读框为723（JrAL5）～771 bp（JrAL3）,等电点为5.04～5.71,全部为酸性不稳定蛋白;含有典型的DUF3594 Domian和PHD domian 2个高度保守的结构域,聚类分析发现,该类基因可与双子叶植物拟南芥较近,与单子叶植物水稻较远。在低温胁迫48 h后经转录表达分析,JrAL2为差异表达基因,并且在种仁和芽中表达较高,在老叶和雄花中较低,推测JrAL2可能响应低温胁迫。
关键词： 核桃 Alfin-like基因家族 生物信息学分析 转录表达分析
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基于SLAF-seq技术连翘SNP分子标记开发及遗传多样性分析
《分子植物育种 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：连翘（Forsythia suspensa （Thunb.） Vahl）是一种极具开发价值的药用植物,本研究利用特异性位点扩增片段测序技术对39份连翘种质资源进行了分子标记开发,通过测序共获得112.28 Mb reads数据,各样本reads数据在1 324 860～5 911 565之间,样本平均测序质量值Q30为96.29%;平均GC含量为36.97%。通过生物信息学分析,本研究获得535 357个SLAF标签,样本的平均测序深度为16.20倍,其中多态性的SLAF标签共有262 297个,开发获得1 809 741个SNP标记。利用开发的SNP分子标记将39份连翘种质资源分为4组,连翘SNP分子标记的研究可为连翘种质资源鉴定和遗传多样性分析提供理论基础。
关键词： 连翘（Forsythia suspensa （Thunb.） Vahl） SNP SLAF-seq技术 分子标记
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