普通烟草MATE基因家族分析及功能预测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张艳艳

作者： 张艳艳;王倩;李晓旭;孙亭亭;龚达平;杨明磊;刘贯山

作者机构：

关键词： 普通烟草;MATE家族;生物信息学分析

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2015 年 16 卷 06 期

页码： 1307-1314

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 植物多药和有毒化合物排出家族(MATE,multidrug and toxic compound extrusion)是一类可转运毒素、金属离子、次级代谢产物的次级转运蛋白家族。该家族主要在植物的解毒机制中发挥作用,部分成员也参与植物的形态建成过程。MATE家族在烟草基因组中的数量、特征及功能目前尚未开展系统分析。本研究利用生物信息学方法对普通烟草(Nicotiana tabacum)基因组中的MATE基因进行了预测分析,共预测到131个基因,分为4个亚家族。亚家族3在进化树中形成较为独立的分枝,其跨膜区数量、亚细胞定位、保守结构域方面与其他亚家族不同。转录组数据显示,相当一部分MATE家族基因在所有组织中低量表达。GO功能注释结果表明该家族成员主要作为一种转运体,在应激响应、生物调控等过程中发挥作用。本研究为烟草及其他植物中MATE家族的鉴定和功能研究提供了数据基础。

分类号： S572

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