羊口疮病毒疫苗株和ORFV-PN株ORFV011基因的比较分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 林裕胜

作者： 林裕胜;江锦秀;张靖鹏;游伟;胡奇林

作者机构：

关键词： 羊口疮病毒;疫苗株;ORFV-PN;ORFV011基因

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2020 年 002 期

页码： 124-129

收录情况： CSCD

摘要： [目的]比较分析羊口疮病毒疫苗株与ORFV-PN株ORFV011基因的分子特点、编码蛋白的生物学功能差异,为福建省羊口疮的科学防控提供理论指导.[方法]对羊口疮疫苗株和ORFV-PN株ORFV011基因进行克隆和测序,运用生物信息学相关软件比较分析两者测序结果的差异.[结果]测序结果显示,疫苗株和ORFV-PN株ORFV011基因均由1 137个核苷酸组成,编码378个氨基酸.核苷酸序列和氨基酸序列相似性比较显示,ORFVPN与疫苗株和弱毒株D1701株ORFV011基因核苷酸序列相似性分别为98.6%和98.4%,氨基酸序列相似性均为98.7%.与疫苗株相比,ORFV-PN株共有16处核苷酸变异和5处氨基酸变异.在蛋白二级结构上,ORFV-PN株和疫苗株α-螺旋占比分别为34.13%(129/378)和30.42%(115/378),β-转角占比分别为6.08%(23/378)和6.88%(26/378),无规则卷曲占比分别为37.30%(141/378)和39.15%(148/378),β-折叠占比分别为22.49%(85/378)和23.54%(89/378).蛋白三级结构上,ORFV-PN株预测的三维结构与疫苗株的三维结构在α-螺旋和无规则卷曲上有一定的差异.[结论]福建省羊口疮病毒ORFV011基因出现变异,应当引起广大兽医工作者的重视,有关部门应当加强对羊口疮的监测.

分类号： S852.654

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