花园君子兰叶绿体基因组序列

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴海红

作者： 吴海红;李丹;冯秀丽;岳玲;赵兴华

作者机构：

关键词： 花园君子兰;叶绿体全基因组;系统发育树

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2023 年 21 卷 020 期

页码： 6659-6665

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 花园君子兰(Clivia gardenii)是君子兰属著名的常绿草本植物.本试验首次研究了花园君子兰的叶绿体基因组.其叶绿体基因组的长度为158 156bp,包括86 307 bp的长单拷贝区域(LSC),18 231 bp的短单拷贝区域(SSC)和26 809bp的反向重复区域(IRs).总的GC含量为37.96%.注释了 130个基因,包括86个编码基因,36个tRNA基因和8个rRNA基因.其中20个基因位于IR重复区,包括7个编码基因,9个tRNA基因和4个rRNA基因.选择石蒜科的12个物种进行系统发育树分析,采用全长基因组序列构建了系统发育树,结果显示C.gardenii和C.miniata形成一个单系群,表明花园君子兰和大花君子兰亲缘关系最近;并且和Hippeastrum、Leucojum、Narcissus、Lycoris等属形成了姐妹群.这些物种也形成了一个单系群,代表了石蒜亚科.本研究结果为君子兰的育种及叶绿体基因工程等研究提供了数据基础.

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