用SAM法分离谷子SSR位点的研究

文献类型: 中文期刊

第一作者: 贾小平

作者: 贾小平;王天宇;黎裕;宋燕春;石云素

作者机构:

关键词: 谷子;选择扩增微卫星法;SSR

期刊名称: 河南农业科学

ISSN: 1004-3268

年卷期: 2009 年 38 卷 08 期

页码: 17-21

收录情况: 北大核心

摘要: 首次将SAM(选择扩增微卫星)法用于谷子SSR位点的分离,共获得163个含有SSR序列的克隆,其中unique SSR 106个,占所有SSR序列的65%,60个SSR序列的3′端成功设计特异引物,占unique SSR的56%。这60个SSR序列中,55个为完整型重复;5个为复合型重复,由2种不同的重复单元组成,没有发现不完整重复类型。同时讨论了SAM法在应用过程中应注意的一些关键技术环节,如接头连接、核苷酸选择策略、特异引物设计原则,及该方法存在的一些不足,如获得SSR重复次数少、一端侧翼序列缺失对扩增多态性的消极影响等。

分类号: S515

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