基于高通量测序技术鉴定栽培草莓资源携带的病毒种类

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘思佳

作者： 刘思佳;曾祥国;肖桂林;王涌;韩永超

作者机构：

关键词： 草莓;病毒病;高通量测序;RT-PCR;草莓白化病毒

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2023 年 019 期

页码： 18-23

收录情况： 北大核心

摘要： 分析草莓种质资源的病毒携带情况，为草莓脱毒种苗的繁育和病毒病的防治提供依据。针对保存的86份栽培草莓材料，分别提取每份材料的叶片总RNA,将待测草莓总RNA混样，然后采用高通量测序技术进行测序。根据每种病毒的序列保守区设计引物，采用RT-PCR对高通量测序的结果进行验证。利用设计的引物分别对每份草莓品种材料进行RT-PCR检测，明确每份材料的带毒情况。测序结果表明，从86份草莓资源中检测出3种病毒，分别为草莓斑驳病毒（strawberry mottle virus,简称SMoV）、草莓镶脉病毒（strawberry vein banding virus,简称SVBV）和草莓白化病毒（strawberry pallidosis-associated virus,简称SPaV）,该结果与RT-PCR验证的结果相符。在所有86份供试样品中，28份材料带有病毒，病毒感染率为32.56%;其中，23份材料带有SVBV;11份材料带有SMoV;5份材料带有SPaV。单一病毒侵染样品18份，复合侵染材料共10份，草莓种苗带毒率高，草莓病毒病危害严重。

分类号： S436.68

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