番茄S-腺苷蛋氨酸脱羧酶基因SlSAMDC1的克隆与序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘志勇

作者： 刘志勇;王孝宣;高建昌;国艳梅;杜永臣;叶雪凌

作者机构：

关键词： 番茄;多胺;S-腺苷蛋氨酸脱羧酶;基因克隆

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2008 年 35 卷 08 期

页码： 1137-1146

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以蔓陀罗S-腺苷蛋氨酸脱羧酶全长cDNA序列为信息探针,筛选NCBI番茄EST数据库,依据同源EST信息,经人工拼接、RT-PCR及RACE技术验证,获得了1个新的SAMDC基因家族成员,命名为SlSAMDC1(GenBank登录号:EF550528),并利用染色体步移技术克隆了879bp的上游调控区域。SlSAMDC1cDNA序列全长1847bp,5′-UTR和3′-UTR分别长523和241bp;存在3个ORF(微型uORF、小型uORF和主ORF),主ORF编码360个氨基酸的SAMDC酶原;SlSAMDC1基因组序列全长3648bp,有3个内含子,均位于5′-UTR,所有内含子的剪切位点均符合真核生物"GT-AG"规则。SlSAMDC1基因与其它植物来源SAMDC基因同源性较高,与人、大肠杆菌以及酵母的同源性较低。表达谱分析发现,SlSAM-DC1基因在番茄根、茎、叶、花蕾、果实等器官中均表达,果实中的表达量相对较高。生物信息学分析表明,SlSMDC1基因的上游调控序列存在多个顺式作用元件,如W-box、TATA-box、CAAT-box等。

分类号： S641.2

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