谢瓦氏曲霉间型变种YchF基因cDNA全长克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李孝霞

作者： 李孝霞;谭玉梅;刘永翔;刘作易

作者机构：

关键词： 谢瓦氏曲霉间型变种;YchF基因;RACE

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2013 年 32 卷 02 期

页码： 185-189

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 从谢瓦氏曲霉间型变种抑制性差减杂交(SSH)文库中,筛选到一个子囊孢子时期差异表达的序列标签A0128.860,以其序列为模板设计特异性引物,利用RT-PCR及RACE技术克隆获得了该基因的全长cD-NA,命名为eYchF。生物信息学分析显示,该基因包含一个1182bp的完整开放阅读框(ORF),编码393个氨基酸,相对分子质量为43.4669kD,预测的理论等电点为6.99,包括一个保守的G domain(guanine nucleotide-binding domain)和一个TGS(ThrRS,GTPase,Spo T)domain,为疏水蛋白。序列同源性分析表明:该基因与棒曲霉(Aspergillus clavatus NRRL1)的GTP结合蛋白YchF相似度为84%,谢瓦氏曲霉间型变种YchF基因的克隆及生物信息学分析为YchF的进一步研究奠定了基础。

分类号： Q78

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