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大白菜叶柄黑点症抗性相关候选基因的挖掘

文献类型： 中文期刊

作者： 雷娟利 1 ; 岳智臣 1 ; 陶鹏 1 ; 赵彦婷 1 ; 李必元 1 ;

作者机构： 1.浙江省农业科学院蔬菜研究所

关键词： 大白菜;叶柄黑点症;抗性;候选基因

期刊名称： 分子植物育种

ISSN：

年卷期： 2021 年 005 期

页码： 1584-1591

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 大白菜叶柄黑点症是严重影响大白菜商品性的一种生理性病害。本研究以抗大白菜叶柄黑点症品系（韩春娃C8-1）和感叶柄黑点症品系（韩春娃-4-2-3-4）为亲本,构建F2群体,通过高N水平水培处理,筛选出高抗叶柄黑点症和高感叶柄黑点症的植株各20株,构建两个极端性状混池DNA文库,通过BSA-Seq技术,对大白菜叶柄黑点症抗性相关候选基因进行挖掘。对于502 662个高质量的SNP位点和173 111个高质量的In Del位点,利用ED和Index方法对这些SNP和InDel位点分别进行关联分析,取所有结果的交集,得到1个包含295个编码基因,位于第1染色体的候选区域,与叶柄黑点数性状紧密关联;对这295个基因进行进一步的功能注释,NR、Swiss-Prot、GO、KEGG和COG数据库共注释到292个基因,其中存在133个非同义突变基因,30个移码突变的基因。候选区域内编码基因的深度注释有助于功能基因的进一步分离,为大白菜叶柄黑点症抗性相关基因的精细定位及克隆提供理论依据。

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