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草菇UBEV2蛋白同源模建筛选其小分子抑制剂

文献类型： 中文期刊

作者： 万佳宁 1 ; 尚俊军 1 ; 汪滢 1 ; 李正鹏 1 ; 王莹 1 ; 唐利华 1 ; 茅文俊 1 ; 汪虹 1 ; 鲍大鹏 1 ; 龚明 1 ;

作者机构： 1.上海市农业科学院食用菌研究所

关键词： 草菇;泛素结合酶E2;虚拟筛选;抗冻保鲜

期刊名称： 食用菌学报

ISSN： 1005-9873

年卷期： 2020 年 27 卷 004 期

页码： 35-42

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 草菇(Volvariella volvacea)具有典型的低温自溶特征,基于草菇低温自溶与一个泛素结合酶E2 (ubiquitin-conjugating enzyme,UBE2)高表达及活性相关,采用虚拟筛选法获得潜在的草菇UBEV2抑制剂小分子化合物.结果 表明:在2轮虚拟筛选方法得到500个靶中化合物的基础上,综合考虑可与UBEV2上的Thr73、Gly77、Ile78、Phe84、Gly85、Asp86、Tyr87、Asp79形成多个氢键,以及Ile78、Leu83、Phe84、Asp86、His138、Ile141等形成较强的疏水作用,最终人工挑选得到150个小分子化合物,对接打分值区间为6.58~8.06.抗冻实验结果提示筛选的化合物能够减轻低温对草菇的伤害.

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