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鲤鱼基因组同源框Hoxa3a序列同源性分析与分子进化研究

文献类型: 中文期刊

作者: 耿波 1 ; 关云涛 2 ; 孙效文 1 ; 匡友谊 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所

2.中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医农业生物技术国家重点实验室

关键词: 鲤;同源框基因;序列同源性;分子进化;SNP

期刊名称: 水产学杂志

ISSN: 1005-3832

年卷期: 2011 年 24 卷 04 期

页码: 52-55

摘要: 本文利用生物信息学软件分析了鲤(Cyprinus carpio)基因组中同源框基因Hoxa3a与多种鱼类及其它生物的同源性,构建了分子进化树。结果表明:鲤与斑马鱼(Danio rerio)的序列同源性最高为95%,与大西洋鲑(Salmo salar)等四种鱼类的同源性次之为84%,与米氏叶吻银鲛(Callorhinchus milii)和鳐(Leucoraja erinacea)的同源性最低为74.5%,与三种鸟类的同源性为75%左右。这结果也说明,Hox同源框基因序列在进化上高度保守。在序列比较的同时发现了2个鲤的SNP位点,T101C和A213G。上述研究结果,对于保护生物多样性(尤其是遗传多样性)的研究,揭示生物进化历程及机理具有十分重要的意义。

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