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棉花SNC2基因的克隆及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 陈方圆 1 ; 王冬梅 2 ; 李波 3 ; 胡文冉 3 ; 杨洋 3 ;

作者机构： 1.新疆师范大学生命科学学院新疆农业科学院核技术生物技术研究所

2.新疆农科院核生所

3.新疆农业科学院核技术生物技术研究所

关键词： 棉花;SNC2;基因克隆;大丽轮枝菌侵染;实时荧光定量

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2017 年 14 卷 01 期

页码： 23-29

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以陆地棉(Gossypium hirsutum)TM-1为材料,利用同源克隆技术从棉花中分离出SNC2基因,以actin基因为内参,采用半定量RT-PCR分析该基因在棉花组织中的表达,并采用实时定量RT-PCR分析不同棉花品种经大丽轮枝菌侵染后,SNC2基因在不同时段、不同组织的表达水平。研究分析发现该基因CDS序列长度为1 308 bp,编码435个氨基酸,蛋白的等电点(p I)为6.98,理论分子量为46.93 k D,命名为SNC2,Gen Bank登录号为AOO35322.1,SNC2基因编码多肽链中包含信号肽和跨膜结构域,且亚细胞定位于质膜,编码受体类蛋白。组织表达分析显示SNC2基因在根、侧根、茎、叶和花中均有表达,茎中的表达量较高,而在苞片组织中基本不表达。该基因在接菌后的感病品种军棉1号的根和耐病品种中棉49号的茎中呈现不断上升的趋势,而在两个棉花品种的其他组织中呈现出"升-降-升"的趋势,且在不同抗性的棉花品种中的表达存在差异,暗示SNC2基因可能在不同抗性品种抵御生物胁迫过程中扮演重要角色,研究结果为进一步研究SNC2基因的功能及应用该基因提供帮助。

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