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真姬菇栽培菌株的ITS和SSR分析

文献类型： 中文期刊

作者： 董岩 1 ; 陈辉 2 ; 赵明文 1 ; 冯志勇 2 ;

作者机构： 1.南京农业大学生命科学院

2.农业部应用真菌资源与利用重点开放实验室

关键词： 真姬菇;简单重复序列(SSR);遗传多样性;内转录间隔区(ITS)

期刊名称： 上海农业学报

ISSN： 1000-3924

年卷期： 2009 年 25 卷 03 期

页码： 65-70

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用ITS和SSR分子标记技术,对27个真姬菇菌株进行遗传分析。通过内转录间隔区(ITS)区域测定和比较分析,结果显示:供试菌株ITS序列长度为594 bp,与GenBank上登录的真姬菇菌株ITS序列相似度为99%以上,在种的水平上证明供试菌株为真姬菇。利用简单重复序列(SSR)标记技术和转移扩增技术,根据香菇、糙皮侧耳、灰盖鬼伞基因组序列设计引物,对真姬菇供试菌株基因组DNA进行扩增。从54对引物中筛选出23对能够扩增出稳定带型且菌株之间带型差异明显的SSR引物。利用23对引物对全部供试菌株进行扩增,共扩增133条条带,其中多态性条带为108条,多态性比率达到81.2%。UPGMA聚类分析结果表明:大部分常规栽培菌株和工厂化栽培菌株聚在不同组,说明两者之间的遗传背景存在明显差异。根据获得菌株的特有SSR标记分析表明:利用7对引物可以将工厂化栽培菌株区分开,其中2个工厂化栽培菌株各自具有1条特异条带,其他工厂化栽培菌株均可通过引物组合法区分开。

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