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基于基因组数据分析的细菌耐药基因识别与表型预测

文献类型： 中文期刊

作者： 周秀娟 1 ; 何逸尘 1 ; 张利达 1 ; 崔妍 1 ; 史贤明 1 ;

作者机构： 1.上海交通大学农业与生物学院中美食品安全联合研究中心微生物代谢国家重点实验室

关键词： 细菌耐药;耐药数据库;生物信息学;耐药基因识别;耐药表型预测

期刊名称： 微生物学报

ISSN： 0001-6209

年卷期： 2024 年 002 期

页码： 432-442

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用基因组数据和生物信息学分析方法，快速鉴定耐药基因并预测耐药表型，为细菌耐药状况监测提供了有力辅助手段。目前，已有的数十个耐药数据库及其相关分析工具这些资源为细菌耐药基因的识别以及耐药表型的预测提供了数据信息和技术手段。随着细菌基因组数据的持续增加以及耐药表型数据的不断积累，大数据和机器学习能够更好地建立耐药表型与基因组信息之间的相关性，因此，构建高效的耐药表型预测模型成为研究热点。本文围绕细菌耐药基因的识别和耐药表型的预测，针对耐药相关数据库、耐药特征识别理论与方法、耐药数据的机器学习与表型预测等方面展开讨论，以期为细菌耐药的相关研究提供手段和思路。

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