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紫苏PfPIN基因家族的全基因组鉴定与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 邹乙菲 1 ; 温贺 1 ; 商志伟 1 ; 杨森 1 ; 秦嘉浩 1 ; 余顺波 1 ; 王文华 1 ;

作者机构： 1.贵州省农业科学院油菜研究所

关键词： 紫苏;生长素;PfPIN基因

期刊名称： 山地农业生物学报

ISSN： 1008-0457

年卷期： 2024 年 003 期

页码： 21-26

摘要： 植物的生长发育与内源生长素的调节密切相关,PIN作为生长素输出载体在生长素的极性运输中起关键作用,调节不同组织的生长发育.本研究基于紫苏全基因组数据鉴定PfPIN基因家族,并进行了生物信息学分析.结果表明:PfPIN基因家族共有15个成员,分布在8个染色体上,可划分为6个不同的分支,PfPIN蛋白长度在350~653 aa之间,分子量在38.10~70.71 kDa之间,等电点在7.18~9.58之间,内含子数量为3~6个,均定位在细胞膜上且具有典型的跨膜结构.启动子顺式作用元件中包括与光、激素、胁迫响应等相关顺式作用元件,其中,光、植物激素响应元件最为常见.本研究将为紫苏生长素相关研究提供方向,为后续紫苏PfPIN基因功能研究奠定基础.

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