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芒果LAR cDNA的电子克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 谭琳 1 ; Azeem Farrukh 2 ; 王南 1 ; 葛宇 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院

2.费萨拉巴德政府大学生物技术与生物信息系

关键词： 电子克隆;SRA;TSA;LAR cDNA

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2020 年 020 期

页码： 6643-6648

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了克服传统的基因电子克隆利用EST数据库需要反复比对与拼接而带来的繁琐,本研究利用SRA、TSA等数据库,通过BLAST搜索同源序列,Serial cloner软件寻找同源序列的开放阅读框架,CLUSTAW比对序列同源性等分析手段,建立了一种基因电子克隆的新方法.通过此方法,获得了芒果无色花青素还原酶(leucocyanidin reductase, LAR)基因的编码序列.根据此编码序列、设计引物,通过RT-PCR扩增,获得了长度为1 062 bp的芒果LAR基因序列,经双酶切、连接等方式,构建了含有LAR基因的重组植物表达载体pMAA-RedMilar.本研究结果将有助于进一步解析芒果LAR基因在原花青素生物合成中的作用,也为其他基因的电子克隆提供了新方法.

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