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基于转录组测序的西瓜果肉硬度相关基因表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 郑雪梦 1 ; 时月 1 ; 王雪敏 2 ; 马越 1 ; 赵晓燕 1 ; 张超 1 ;

作者机构： 1.北京市农林科学院蔬菜研究中心

2.河北工程大学

关键词： 西瓜;硬度;转录组;差异表达基因

期刊名称： 中国瓜菜

ISSN： 1673-2871

年卷期： 2020 年 33 卷 010 期

页码： 15-22

摘要： 以脆肉型'京欣3号'西瓜和硬肉型'甜王'西瓜为样品,评价果肉硬度表型差异,并利用转录组测序技术检测2个品种间差异表达基因.结果发现,'甜王'西瓜品种果肉硬度是'京欣3号'西瓜的1.9倍,表型与'京欣3号'西瓜具有显著性差异.转录组测序结果显示,与'京欣3号'西瓜相比,'甜王'西瓜样品有5342个基因差异表达,其中2360个基因上调表达,2982个基因下调表达.差异基因主要注释在碳水化合物代谢、信号转导、脂质代谢等途径,其中与果肉硬度变化的候选基因主要包括果胶酯酶、果胶裂合酶、聚半乳糖醛酸酶、纤维素酶、纤维素合酶、β-半乳糖苷酶、β-葡萄糖苷酶、酸性几丁质酶、几丁质酶、木葡聚糖内转葡糖基酶/水解酶和脂氧合酶基因.钙调蛋白、乙烯反应转录因子、乙烯不敏感样蛋白、WRKY转录因子、MYC2转录因子、过氧化氢酶、呼吸爆发氧化酶和脱落酸受体PYR1参与果肉细胞活动信号转导,可能与果肉硬度相关.

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