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猪PKM2基因的序列分析与组织表达及亚细胞定位

文献类型: 中文期刊

作者: 赵为民 1 ; 涂枫 1 ; 方晓敏 1 ; 王学敏 1 ; 付言峰 1 ; 李碧侠 1 ; 周李生 1 ; 任守文 1 ;

作者机构: 1.江苏省农业科学院畜牧研究所;农业部种养结合重点实验室;江苏省农业种质资源保护与利用平台

关键词: 猪;PKM2基因;序列分析;组织表达;亚细胞定位

期刊名称: 湖南农业大学学报(自然科学版)

ISSN: 1007-1032

年卷期: 2019 年 01 期

页码: 68-77

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 运用RT–PCR技术克隆猪PKM2基因的编码区序列,对该序列进行生物信息学分析,研究PKM2基因的组织表达及亚细胞定位。结果显示:猪PKM2基因CDS全长1 596 bp,编码531个氨基酸;预测其蛋白相对分子质量为5.79×104,等电点为7.96,含有多个磷酸化位点,为稳定蛋白;PKM2蛋白含有丙酮酸激酶家族的barreldomain和alpha/beta domain 2个结构域,其蛋白二级结构中α–螺旋和无规则卷曲占主要类型;猪PKM2蛋白序列在物种间非常保守,系统进化树分析表明,该蛋白与兔的亲缘关系最近;组织表达显示,猪PKM2基因在肾、小肠中相对高表达,而在肝脏与肌肉中相对低表达;亚细胞定位显示,PKM2蛋白在猪3D4/21和PK15细胞中表达于细胞质,而不表达于细胞核。

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