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副猪嗜血杆菌广东分离株外膜蛋白P5基因的克隆及蛋白结构预测

文献类型： 中文期刊

作者： 陈善真 1 ; 王贵平 1 ; 曾振灵 2 ; 李春玲 1 ; 贾爱卿 1 ; 杨冬霞 1 ;

作者机构： 1.广东省农业科学院

2.华南农业大学

关键词： 副猪嗜血杆菌;外膜蛋白P5基因;基因克隆;蛋白结构预测

期刊名称： 中国兽医学报

ISSN： 1005-4545

年卷期： 2010 年 30 卷 02 期

页码： 206-210

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据GenBank上发表的副猪嗜血杆菌(HPS)外膜蛋白基因的核苷酸序列设计并合成1对特异性引物,从广东省HPS分离株外膜蛋白P5基因中扩增出与预期设计的1116bp大小相符的片段,将扩增产物连接到pMD18-T载体上,进行序列测定和分析。结果表明,克隆出HPS广东分离株的目的基因,核苷酸长为1116bp,共编码371个氨基酸,与已发表的HPS(SH0165)外膜蛋白基因核苷酸序列同源性100%,氨基酸同源性100%。生物学预测分析结果显示,HPS外膜蛋白是一种混合型结构蛋白,含有α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规则卷曲,其β-转角和无规则卷曲区域可能形成抗原表位;其N端含有1个信号肽,最佳切割位点在21～22个氨基酸;有15个抗原决定簇;无跨膜区;同源建模分析,未见相似三维结构。

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