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SRAP分子标记分析体系的建立及白簕资源亲缘关系分析

文献类型: 中文期刊

作者: 林春华 1 ; 李兆龙 2 ; 乔燕春 1 ; 林伟君 3 ; 刘自珠 1 ; 谭雪 1 ;

作者机构: 1.广州市农业科学研究院

2.仲恺农业工程学院生命科学学院

3.广东省农科院科技情报研究所

关键词: 白簕;SRAP反应体系;优化;系统分析

期刊名称: 基因组学与应用生物学

ISSN: 1674-568X

年卷期: 2012 年 05 期

页码: 498-504

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本实验对影响SRAP-PCR体系中的Mg2+、dNTPs和引物浓度等因子进行了体系优化,建立了一套适合白簕SRAP检测的25μL反应体系:1.5mmol/LMg2+,1.5mmol/LdNTPs,1μmol/L引物,10ng模板DNA,1.5UTaqDNA聚合酶;进一步以白梗簕菜为模板,利用优化的体系进行多态性标记引物组合分析,共筛选出17对引物;利用这些引物对7个白簕品种进行SRAP遗传多样性分析,共扩增出461条谱带。其中多态性谱带155条,多态性谱带比率为33.6%,白簕品种间的相似系数为0.7077~0.9474。经UPGMA聚类分析结果显示,所检测的7个白簕品种分为两大类,其中亲缘关系较近的青梗簕菜和细叶密刺簕菜聚成了一组;而其余的4个种,包括白梗簕菜、细叶小刺簕菜、紫柄簕菜、大叶大刺簕菜和红梗簕菜,聚成另一组。

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